Майнор Биоинформатика 2 год 2024/25 — различия между версиями
Материал из Wiki - Факультет компьютерных наук
(Новая страница: «== Модули 1 и 2 - Анализ данных секвенирования == === Формула расчет оценки === Накоп = Округле…») |
м (→Лекции и семинары) |
||
| Строка 14: | Строка 14: | ||
|| 05.09 | || 05.09 | ||
|| | || | ||
| − | Введение в молекулярную биологию | + | Введение в молекулярную биологию [https://docs.google.com/presentation/d/12oKuLshen8uNRDt4oGRLy2KB_tSSM6kM/edit?usp=sharing&ouid=109540323021403462314&rtpof=true&sd=true лекция] |
|| | || | ||
| − | Создание аккаунтов на серверах | + | Создание аккаунтов на серверах [https://eduhseru-my.sharepoint.com/:p:/g/personal/dkonovalov_hse_ru/ETv2W6XIVMlHhCkRYuBjbQsB7-tWr1pA3FrV9tZ7aip7OQ?e=IMwjTw инструкция] |
|- | |- | ||
| 2 | | 2 | ||
|| 12.09 | || 12.09 | ||
|| | || | ||
| − | Методы секвенирования ДНК | + | Методы секвенирования ДНК [https://docs.google.com/presentation/d/1KJkfCy8emELTJvQ7XhTknNJdCH9Dh2oD/edit?usp=sharing&ouid=109540323021403462314&rtpof=true&sd=true лекция] |
| − | || Введение в github и Google colab | + | || Введение в github и Google colab. Sra toolkit [https://colab.research.google.com/drive/1BEYKTOqEHpV0-NpnK7Z_OLr9uD7VTB0Q?usp=sharing тетрадка] |
|- | |- | ||
| 3 | | 3 | ||
Версия 17:05, 12 сентября 2024
Модули 1 и 2 - Анализ данных секвенирования
Формула расчет оценки
Накоп = Округление( Среднее(ДЗ1+ДЗ2+ДЗ3+ДЗ4+ДЗ5+квиз)*0.8 ) Студент имеет право зачесть Накоп в качестве итоговой оценки, не приходя на экзамен. В случае сдачи экзамена к оценке Накоп добавляется 0.3*Э. Экзамен письменный, оценивается по 10-бальной шкале
Лекции и семинары
| # | Дата | Лекция (11:10 - 12:30) | Семинар (12:40 - 14:00) |
|---|---|---|---|
| 1 | 05.09 |
Введение в молекулярную биологию лекция |
Создание аккаунтов на серверах инструкция |
| 2 | 12.09 |
Методы секвенирования ДНК лекция |
Введение в github и Google colab. Sra toolkit тетрадка |
| 3 | 19.09 |
Сборка генома |
ДЗ1 Сборка генома |
| 4 | 26.09 |
Алгоритмы предсказания генов |
Алгоритмы предсказания генов. Практика |
| 5 | 10.10 |
Аннотация функций генов |
ДЗ2 Аннотация генома |
| 6 | 17.10 |
Сдвиг рамки считывания |
Семинар |
| 7 | 24.10 |
Геном человека и некодирующие РНК |
ДЗ3 Предсказание генов |
| Сессия | |||
| 8 | 31.10 |
Введение в РНК-сек |
ДЗ4 РНК-сек |
| 9 | 07.11 |
Анализ данных РНК-сек |
Анализ данных РНК-сек |
| 11 | 14.11 |
Секвенирование отдельных клеток [ |
ДЗ5 single cell РНК-сек |
| 12 | 21.11 | Проверочная работа по теме РНК-сек | Разбор ДЗ5 single cell РНК-сек |
| 13 | 28.11 | GWAS | GWAS |
| 14 | 05.12 | Метагеномика. Лекция | Семинар |
| 15 | 12.12 | Заключение | Заключение. Дописывание квиза. |
| 16 | 19.12 | Экзамен | |
