Майнор Биоинформатика 2 год 2024/25

Материал из Wiki - Факультет компьютерных наук
Перейти к: навигация, поиск

Модули 1 и 2 - Анализ данных секвенирования

Формула расчет оценки

Накоп = Округление( Среднее(ДЗ1+ДЗ2+ДЗ3+ДЗ4+ДЗ5+квиз)*0.8 )
Студент имеет право зачесть Накоп в качестве итоговой оценки, не приходя на экзамен.
В случае сдачи экзамена к оценке Накоп добавляется 0.3*Э. Экзамен письменный, оценивается по 10-бальной шкале

Лекции и семинары

# Дата Лекция (11:10 - 12:30) Семинар (12:40 - 14:00)
1 05.09

Введение в молекулярную биологию лекция

Создание аккаунтов на серверах инструкция

2 12.09

Методы секвенирования ДНК лекция

Введение в github и Google colab. Sra toolkit тетрадка
3 19.09

Сборка генома слайды

ДЗ1 Сборка генома текст

4 26.09

Алгоритмы предсказания генов слайды

Алгоритмы предсказания генов. Практика

5 03.10

Аннотация функций генов слайды

ДЗ2 Аннотация генома текст

6 10.10

Сдвиг рамки считывания слайды

Семинар

7 24.10

Геном человека и некодирующие РНК слайды

ДЗ3 Предсказание генов текст

8 31.10

Введение в РНК-сек слайды

Семинар о РНК-сек

Сессия
9 07.11

Анализ данных РНК-сек слайды

ДЗ4 РНК-сек слайды

11 14.11

Секвенирование отдельных клеток слайды

ДЗ5 single cell РНК-сек

12 21.11 Проверочная работа по теме РНК-сек Разбор ДЗ5 single cell РНК-сек
13 28.11 GWAS GWAS
14 05.12 Метагеномика. Лекция Семинар
15 12.12 Заключение Заключение. Дописывание квиза.
16 19.12 Экзамен