Майнор Биоинформатика 2 год 2024/25
Материал из Wiki - Факультет компьютерных наук
Модули 1 и 2 - Анализ данных секвенирования
Формула расчет оценки
Накоп = Округление( Среднее(ДЗ1+ДЗ2+ДЗ3+ДЗ4+ДЗ5+квиз)*0.8 ) Студент имеет право зачесть Накоп в качестве итоговой оценки, не приходя на экзамен. В случае сдачи экзамена к оценке Накоп добавляется 0.3*Э. Экзамен письменный, оценивается по 10-бальной шкале
Лекции и семинары
# | Дата | Лекция (11:10 - 12:30) | Семинар (12:40 - 14:00) |
---|---|---|---|
1 | 05.09 |
Введение в молекулярную биологию лекция |
Создание аккаунтов на серверах инструкция |
2 | 12.09 |
Методы секвенирования ДНК лекция |
Введение в github и Google colab. Sra toolkit тетрадка |
3 | 19.09 |
Сборка генома слайды |
ДЗ1 Сборка генома текст |
4 | 26.09 |
Алгоритмы предсказания генов слайды |
Алгоритмы предсказания генов. Практика |
5 | 03.10 |
Аннотация функций генов слайды |
ДЗ2 Аннотация генома текст |
6 | 10.10 |
Сдвиг рамки считывания слайды |
Семинар |
7 | 24.10 |
Геном человека и некодирующие РНК слайды |
ДЗ3 Предсказание генов текст |
8 | 31.10 |
Введение в РНК-сек слайды |
Семинар о РНК-сек |
Сессия | |||
9 | 07.11 |
Анализ данных РНК-сек слайды |
ДЗ4 РНК-сек слайды |
11 | 14.11 |
Секвенирование отдельных клеток слайды |
ДЗ5 single cell РНК-сек |
12 | 21.11 | Проверочная работа по теме РНК-сек | Разбор ДЗ5 single cell РНК-сек |
13 | 28.11 | GWAS | GWAS |
14 | 05.12 | Метагеномика. Лекция | Семинар |
15 | 12.12 | Заключение | Заключение. Дописывание квиза. |
16 | 19.12 | Экзамен |