Майнор Биоинформатика 2 год
Лекции
Модули 1 и 2
Лекция 1 (03.09.2020). Секвенирование. Введение.
Лекция 2 (10.09.2020). Введение в молекулярную биологию.
Лекции 3 и 4 (17.09-01.10 2020). Поиск полиморфизмов.
Лекция 5 (08.10.2020). Инструменты работы с данными. Bedtools
Блок Транскрипция, ее регуляция, и как ее изучают
Лекция 1 Транскрипция, ее регуляция, и как ее изучают (часть 1)
Лекция 2 Транскрипция, ее регуляция, и как ее изучают (часть 2)
Лекция 3 Транскрипция, ее регуляция, и как ее изучают (часть 3)
Лекция 4 Транскрипция, ее регуляция, и как ее изучают (часть 4)
Блок лекций о структуре хроматина
Лекция 1 Введение в структуру хроматина
Лекция 2 Практическая работа с данными Hi-C
Лекция 3 Поиск особенностей структуры хроматина
Лекция 4 и 5 Ассоциация данных о хроматине и специальные протоколы
Эпигенетика
ИНСТРУКЦИЯ ДЛЯ РАБОТЫ НАД ПРОЕКТОМ
- (18.03.2021) Занятие 1 -- введение в эпигенетику и обзор анализа данных РНК-сек:
- (25.03.2021) Занятие 2 -- РНК-сек (polyA и total RNA-seq, RPKM, FPKM) и визуализация выравненных чтений РНК-сек в геномном браузере:
- (08.04.2021) Занятие 3 -- типы эпигенетической регуляции и более подробно про метилирование ДНК (начало):
- (15.04.2021) Занятие 4 -- метилирование ДНК:
- (22.04.2021) Занятие 5 -- доступность ДНК (DNAse-seq, ATAC-seq):
- (29.04.2021) Занятие 6 -- модификации гистонов и обзор проекта ENCODE:
- (13.05.2021) Занятие 7 - ChomHMM и начало работы над проектом:
- (20.05.2021) Занятие 8 - структуры ДНК и создание github репозитория:
- (27.05.2021) Занятие 9 - DeepZ (Назар Бекназаров) и анализ разметки вторичной структуры ДНК:
- (03.06.2021) Занятие 10 - Сдвиги рамки считывания, АТФ и работа над проектом в группах:
- (10.06.2021) Занятие 11 - защиты проектов группами:
- Видео: часть 1
