Майнор Биоинформатика 2 год 2025/26
Материал из Wiki - Факультет компьютерных наук
Модули 1 и 2 - Анализ данных секвенирования
Формула расчет оценки
Накоп = Округление( Среднее(ДЗ1+ДЗ2+ДЗ3+ДЗ4+ДЗ5+квиз)*0.7 ) Студент имеет право зачесть Накоп в качестве итоговой оценки, не приходя на экзамен. В случае сдачи экзамена к оценке Накоп добавляется 0.3*Э. Экзамен письменный, оценивается по 10-бальной шкале
Лекции и семинары
| # | Дата | Лекция (11:10 - 12:30) | Семинар (12:40 - 14:00) |
|---|---|---|---|
| 1 | 04.09 |
Введение в молекулярную биологию лекция |
Создание аккаунтов на серверах инструкция |
| 2 | 11.09 |
Методы секвенирования ДНК лекция |
Введение в github и Google colab. Sra toolkit тетрадка |
| 3 | 18.09 |
Сборка генома слайды |
FastQC, MultiQC, cборка генома |
| 4 | 26.09 |
Алгоритмы предсказания генов слайды |
Алгоритмы предсказания генов. Практика |
| 5 | 03.10 |
Аннотация функций генов. Домены. слайды |
InterPro. PFam. HMMER. |
| 6 | 9.10 |
Сдвиг рамки считывания |
Семинар |
| 7 | 16.10 |
Некодирующие РНК слайды |
Infernal, tRNAscan |
| 8 | 23.10 |
Введение в РНК-сек слайды |
Введение в R, Deseq2 |
| 9 | 06.11 |
Анализ данных РНК-сек слайды |
ДЗ3 РНК-сек. scRNA-seq QC тетрадка |
| 10 | 13.11 |
Анализ данных РНК-сек часть 2 слайды |
Семинар тетрадка |
| 9 | 27.11 |
Определение типа клеток. слайды |
Семинар тетрадка |
| 9 | 06.11 |
Остальные виды анализа данных РНК-сек слайды |
ДЗ34 scРНК-сек |
