MinorBioinformatics — различия между версиями

Материал из Wiki - Факультет компьютерных наук
Перейти к: навигация, поиск
Строка 1: Строка 1:
 
'''Часть 1. Элементарная геномика (модули 1-2)'''
 
'''Часть 1. Элементарная геномика (модули 1-2)'''
  
   В курсе «Элементарная геномика»  изучаются основные закономерности молекулярной эволюции и математические методы анализа молекулярных последовательностей, включая алгоритмы поиска гомологичных последовательностей, выравнивания последовательностей и построения филогенетических деревьев, алгоритмы поиска ортологов и горизонтально перенесенных генов, предсказания генов и поиск мотивов, методы аннотации геномов de novo генами и функциональными элементами. Изучаются алгоритмы и методы предсказания вторичной структуры ДНК, РНК и белков.  
+
    
  В течение курса студенты познакомятся с основными биоинформатическими ресурсами, включая базы данных, веб-порталы, компьютерные программы для работы с базами данных молекулярной биологии, а также программами, реализующими биоинформатические методы.
+
<nowiki>В курсе «Элементарная геномика»  изучаются основные закономерности молекулярной эволюции и математические методы анализа молекулярных последовательностей, включая алгоритмы поиска гомологичных последовательностей, выравнивания последовательностей и построения филогенетических деревьев, алгоритмы поиска ортологов и горизонтально перенесенных генов, предсказания генов и поиск мотивов, методы аннотации геномов de novo генами и функциональными элементами. Изучаются алгоритмы и методы предсказания вторичной структуры ДНК, РНК и белков.</nowiki><br /><br /> 
 
+
<nowiki>В течение курса студенты познакомятся с основными биоинформатическими ресурсами, включая базы данных, веб-порталы, компьютерные программы для работы с базами данных молекулярной биологии, а также программами, реализующими биоинформатические методы.</nowiki>
  
 +
  
  
Строка 11: Строка 12:
  
 
'''Лекция 1.''' Введение. Основы молекулярной биологии.
 
'''Лекция 1.''' Введение. Основы молекулярной биологии.
Клетка, геном, белки, поток информации, генетический код.  
+
Клетка, геном, белки, поток информации, генетический код. <br />
 
([https://drive.google.com/open?id=1SEOTQyumGUff8Bwu54skDpu0ts38PfMG презентация])
 
([https://drive.google.com/open?id=1SEOTQyumGUff8Bwu54skDpu0ts38PfMG презентация])
  
Строка 17: Строка 18:
 
'''Семинары'''
 
'''Семинары'''
  
'''Семинар 1.''' Введение в систему Unix. Основные команды Unix. Файловая система. Навигация. Командная строка. Просмотр файлов. Bash-скрипты.
+
'''Семинар 1.''' Введение в систему Unix. Основные команды Unix. Файловая система. Навигация. Командная строка. Просмотр файлов. Bash-скрипты.<br />
 
([https://drive.google.com/open?id=1hLa__Y062bnLyZ4-vytNgD-Pn61Ff0SC содержание])([https://drive.google.com/drive/folders/1jszxyxC9TIo_RMlfp6FDfWw7gOIKP7Sb?usp=sharing данные])
 
([https://drive.google.com/open?id=1hLa__Y062bnLyZ4-vytNgD-Pn61Ff0SC содержание])([https://drive.google.com/drive/folders/1jszxyxC9TIo_RMlfp6FDfWw7gOIKP7Sb?usp=sharing данные])

Версия 14:15, 10 сентября 2019

Часть 1. Элементарная геномика (модули 1-2)


В курсе «Элементарная геномика» изучаются основные закономерности молекулярной эволюции и математические методы анализа молекулярных последовательностей, включая алгоритмы поиска гомологичных последовательностей, выравнивания последовательностей и построения филогенетических деревьев, алгоритмы поиска ортологов и горизонтально перенесенных генов, предсказания генов и поиск мотивов, методы аннотации геномов de novo генами и функциональными элементами. Изучаются алгоритмы и методы предсказания вторичной структуры ДНК, РНК и белков.

В течение курса студенты познакомятся с основными биоинформатическими ресурсами, включая базы данных, веб-порталы, компьютерные программы для работы с базами данных молекулярной биологии, а также программами, реализующими биоинформатические методы.



Лекции

Лекция 1. Введение. Основы молекулярной биологии. Клетка, геном, белки, поток информации, генетический код.
(презентация)


Семинары

Семинар 1. Введение в систему Unix. Основные команды Unix. Файловая система. Навигация. Командная строка. Просмотр файлов. Bash-скрипты.
(содержание)(данные)