Разработка приложения для проведения биологических симуляций (проект)

Ментор	Никитин Алексей
Учебный семестр	Осень 2016
Учебный курс	2-й курс
Проект можно развивать на летней практике
Максимальное количество студентов, выбравших проект: 2

Что это за проект?

Проект разрабатывается при взаимодействии с научной группой немецкого учёного Ульфа Дикмана (институт IIASA, Laxenburg, Austria). Требуется разработать утилиту, основанную на генерации случайных величин, реализующую биологические симуляции модели, описывающей популяции стационарных сообществ. Данные симуляции будут использоваться для подтверждения/опровержения результатов численных экспериментов с системой интегро-дифференциальных уравнений.

На входе задаются параметры модели, а также выбирается один из перечисленных биологических сценариев, на выходе выдаётся числовой массив, по которому возможно изобразить подходящие графики.

Чему вы научитесь?

Студент ознакомится с методами математической биологии, численными методами решения интегральных уравнений, языку программирования Matlab, работе с суперкомпьютерными вычислениями (у нашей научной группы есть доступ к суперкомпьютеру "Ломоносов").

Сможете улучшить свой английский язык, изучая литературу в зарубежных изданиях, и общаясь с австрийскими коллегами.

Какие начальные требования?

знание английского языка и языка программирования C/C++ хотя бы на начальном уровне.

Какие будут использоваться технологии?

алгоритмы системы Matlab, ГРИД, OpenMP

Темы вводных занятий

модель Ульфа Дикамна, одновидовые и двухвидовые модели стационарных сообществ, случайные процессы.

Направления развития

распараллеливание алгоритмов для эффективного вычисления на суперкомпьютере.

Критерии оценки

Будет объявлено позже

Ориентировочное расписание занятий

ПН недоступен, ВТ 15:00 - 18:00, СР недоступен, ЧТ по предварительной договорённости, ПТ по предварительной договорённости, СБ 12:10 - 14:00