Моделирование пространственной структуры РНК (front-end) (проект) — различия между версиями

Материал из Wiki - Факультет компьютерных наук
Перейти к: навигация, поиск
(Новая страница: «{{Карточка_проекта |name=Моделирование пространственной структуры РНК (front-end) |mentor=Залевски…»)
 
Строка 32: Строка 32:
  
 
=== Направления развития ===
 
=== Направления развития ===
 
+
* Реализовать очередь задач;
 
* Реализовать рассылку почтовых уведомлений о выполнении задачи;
 
* Реализовать рассылку почтовых уведомлений о выполнении задачи;
 
* Реализовать ограниченный доступ к выдаче и файлам задачи;
 
* Реализовать ограниченный доступ к выдаче и файлам задачи;
Строка 39: Строка 39:
  
 
=== Критерии оценки ===
 
=== Критерии оценки ===
4-5 Переработать существующий протопип, реализовать базовую функциональность фронтэнда (загрузку данных, выдачу результата); <br/>
+
4-5 Переработать существующий протопип, реализовать базовую функциональность фронтэнда (загрузку данных, очередь задач, рассылка уведомлений, выдачу результата); <br/>
 
6-7 Реализовать ограничения доступа;<br/>
 
6-7 Реализовать ограничения доступа;<br/>
 
8-10 Реализовать интерактивную страницу с очередью и состоянием задачи. Реализовать визуализацию 3D структур РНК на странице с выдачей результатов.
 
8-10 Реализовать интерактивную страницу с очередью и состоянием задачи. Реализовать визуализацию 3D структур РНК на странице с выдачей результатов.

Версия 15:24, 17 января 2015

Ментор Залевский Артур
Учебный семестр Весна 2015
Учебный курс 1-й курс



Что это за проект?

Мы сформулировали и применили свой подход к реконструкции пространственной структуры РНК на основе данных о вторичной структуре и дополнительных дистанционных ограничений, который показал хорошие результаты при сравнении с полученными позже экспериментальными данными. После публикации статьи мы сделали веб-сервис, реализующий этот подход, однако он уже порядком устарел и мы хотели бы его существенно улучшить, как с точки зрения науки, так и качества реализации.

Чему вы научитесь?

  • Познакомитесь с пространственными структурами различных биомолекул.
  • Приобретете опыт по разработке веб-сервисов научной направленности.

Какие начальные требования?

  • Желание разобраться в структурном многообразии нуклеиновых кислот.
  • Желание создать научный веб-сервис
  • Базовые знания ОС GNU/Linux.
  • Базовые знания Shell, Python.

Какие будут использоваться технологии?

Темы вводных занятий

  • Нуклеиновые кислоты, связь структура - функция.

Направления развития

  • Реализовать очередь задач;
  • Реализовать рассылку почтовых уведомлений о выполнении задачи;
  • Реализовать ограниченный доступ к выдаче и файлам задачи;
  • Реализовать интерактивную страницу с очередью и состоянием задачи;
  • Реализовать визуализацию 3D структур биомолекул на странице с выдачей результатов.

Критерии оценки

4-5 Переработать существующий протопип, реализовать базовую функциональность фронтэнда (загрузку данных, очередь задач, рассылка уведомлений, выдачу результата);
6-7 Реализовать ограничения доступа;
8-10 Реализовать интерактивную страницу с очередью и состоянием задачи. Реализовать визуализацию 3D структур РНК на странице с выдачей результатов.