Майнор Биоинформатика 2 год 2023/24 — различия между версиями

Материал из Wiki - Факультет компьютерных наук
Перейти к: навигация, поиск
м (Лекции и семинары)
м (Лекции и семинары)
Строка 86: Строка 86:
 
Секвенирование отдельных клеток [https://disk.yandex.ru/i/Q6CkgPoxnQ7NIg видео] [https://docs.google.com/presentation/d/1TkAd7eVwyzJOvxHX1HquhIwWHJGRoepv/edit?usp=sharing&ouid=109540323021403462314&rtpof=true&sd=true слайды]
 
Секвенирование отдельных клеток [https://disk.yandex.ru/i/Q6CkgPoxnQ7NIg видео] [https://docs.google.com/presentation/d/1TkAd7eVwyzJOvxHX1HquhIwWHJGRoepv/edit?usp=sharing&ouid=109540323021403462314&rtpof=true&sd=true слайды]
 
||
 
||
'''ДЗ5''' single cell РНК-сек   
+
'''ДЗ5''' single cell РНК-сек  [https://docs.google.com/document/d/1ugGy1wBI2SI0rvMdN8pi-MaXEvqEGYtJGOiyF3vYsEM/edit?usp=sharing текст]
 
|-
 
|-
 
| 12
 
| 12
Строка 92: Строка 92:
 
||
 
||
 
Проверочная работа по теме РНК-сек
 
Проверочная работа по теме РНК-сек
|| GWAS и популяционная генетика
+
|| Разбор '''ДЗ5''' single cell РНК-сек
 
|-
 
|-
 
| 13
 
| 13

Версия 18:56, 24 ноября 2023

Модули 1 и 2 - Анализ данных секвенирования

Формула расчет оценки

Накоп = Округление( (ДЗ1+ДЗ2+ДЗ3+ДЗ4+ДЗ5+квиз)/6 )
Студент имеет право зачесть Накоп в качестве итоговой оценки, не приходя на экзамен.
В случае сдачи экзамена к оценке Накоп добавляется 0.3*Э. Экзамен письменный, оценивается по 10-бальной шкале

Лекции и семинары

Это примерный план, будут изменения.


# Дата Лекция (11:10 - 12:30) Семинар (12:40 - 14:00)
1 07.09

Введение в молекулярную биологию презентация видео

Создание аккаунтов на серверах инструкция

2 14.09

Методы секвенирования ДНК слайды видео

Введение в github и Google colab команды с занятия
3 21.09

Сборка генома слайды видео

ДЗ1 Сборка генома текст

4 28.09

Алгоритмы предсказания генов слайдывидео

Алгоритмы предсказания генов. Практика

5 05.10

Аннотация функций генов видео слайды

ДЗ2 Аннотация генома

6 12.10

Сдвиг рамки считывания слайды видео

Семинар тетрадка

7 19.10

Геном человека и некодирующие РНК видео слайды

ДЗ3 Предсказание генов текст

Сессия
8 02.11

Введение в РНК-сек видео слайды

ДЗ4 РНК-сек текст

9 09.11

Анализ данных РНК-сек слайды видео

Анализ данных РНК-сек

11 16.11

Секвенирование отдельных клеток видео слайды

ДЗ5 single cell РНК-сек текст

12

Проверочная работа по теме РНК-сек

Разбор ДЗ5 single cell РНК-сек
13

Развитие жизни на Земле

Разбор оценок за все ДЗ
14 Экзамен