Майнор Биоинформатика 2 год 2023/24 — различия между версиями
Материал из Wiki - Факультет компьютерных наук
м (→Лекции и семинары) |
м (→Лекции и семинары) |
||
| Строка 68: | Строка 68: | ||
|- | |- | ||
| 8 | | 8 | ||
| − | || | + | || 02.11 |
|| | || | ||
Введение в РНК-сек [https://disk.yandex.ru/i/OPTAZfvSDj_Ljw видео] [https://docs.google.com/presentation/d/12j8h7g6biR1L28TXsN8K3I2kuSpBC4Uy/edit?usp=drive_link&ouid=109540323021403462314&rtpof=true&sd=true слайды] | Введение в РНК-сек [https://disk.yandex.ru/i/OPTAZfvSDj_Ljw видео] [https://docs.google.com/presentation/d/12j8h7g6biR1L28TXsN8K3I2kuSpBC4Uy/edit?usp=drive_link&ouid=109540323021403462314&rtpof=true&sd=true слайды] | ||
| Строка 74: | Строка 74: | ||
'''ДЗ4''' РНК-сек [https://docs.google.com/document/d/1EBUeVC1JdKV3eRgfAFVvFxlPxuF4Wgo4AFG6KDHIc6c/edit?usp=sharing текст] | '''ДЗ4''' РНК-сек [https://docs.google.com/document/d/1EBUeVC1JdKV3eRgfAFVvFxlPxuF4Wgo4AFG6KDHIc6c/edit?usp=sharing текст] | ||
|- | |- | ||
| − | | | + | | 9 |
| − | || | + | || 09.11 |
| − | + | ||
| − | + | ||
| − | + | ||
| − | + | ||
|| | || | ||
| − | Анализ данных РНК-сек | + | Анализ данных РНК-сек [https://docs.google.com/presentation/d/14YX0cJuSRs33FSZRO64VG851Mjqq37ch/edit?usp=sharing&ouid=109540323021403462314&rtpof=true&sd=true слайды] [https://disk.yandex.ru/i/yRTjy5O7i1sY9A видео ] |
|| | || | ||
Анализ данных РНК-сек | Анализ данных РНК-сек | ||
|- | |- | ||
| 11 | | 11 | ||
| + | || 16.11 | ||
|| | || | ||
| − | + | Секвенирование отдельных клеток | |
| − | + | ||
|| | || | ||
'''ДЗ5''' single cell РНК-сек | '''ДЗ5''' single cell РНК-сек | ||
| Строка 95: | Строка 91: | ||
|| | || | ||
|| | || | ||
| − | + | Проверочная работа по теме РНК-сек | |
|| GWAS и популяционная генетика | || GWAS и популяционная генетика | ||
|- | |- | ||
Версия 20:02, 15 ноября 2023
Модули 1 и 2 - Анализ данных секвенирования
Формула расчет оценки
Накоп = Округление( (ДЗ1+ДЗ2+ДЗ3+ДЗ4+ДЗ5+квиз)/6 ) Студент имеет право зачесть Накоп в качестве итоговой оценки, не приходя на экзамен. В случае сдачи экзамена к оценке Накоп добавляется 0.3*Э. Экзамен письменный, оценивается по 10-бальной шкале
Лекции и семинары
Это примерный план, будут изменения.
| # | Дата | Лекция (11:10 - 12:30) | Семинар (12:40 - 14:00) |
|---|---|---|---|
| 1 | 07.09 |
Введение в молекулярную биологию презентация видео |
Создание аккаунтов на серверах инструкция |
| 2 | 14.09 | Введение в github и Google colab команды с занятия | |
| 3 | 21.09 |
ДЗ1 Сборка генома текст | |
| 4 | 28.09 |
Алгоритмы предсказания генов. Практика | |
| 5 | 05.10 |
ДЗ2 Аннотация генома | |
| 6 | 12.10 |
Семинар тетрадка | |
| 7 | 19.10 |
ДЗ3 Предсказание генов текст | |
| Сессия | |||
| 8 | 02.11 |
ДЗ4 РНК-сек текст | |
| 9 | 09.11 |
Анализ данных РНК-сек | |
| 11 | 16.11 |
Секвенирование отдельных клеток |
ДЗ5 single cell РНК-сек |
| 12 |
Проверочная работа по теме РНК-сек |
GWAS и популяционная генетика | |
| 13 |
Развитие жизни на Земле |
Разбор оценок за все ДЗ | |
| 14 | Экзамен | ||
