Майнор Биоинформатика 2 год 2023/24 — различия между версиями

Материал из Wiki - Факультет компьютерных наук
Перейти к: навигация, поиск
м
м (Лекции и семинары)
Строка 30: Строка 30:
 
|| 21.09
 
|| 21.09
 
||
 
||
Сборка генома  [https://docs.google.com/presentation/d/16sZRHNNLHTl8FSH5GXlwgHwLNN_jJro0/edit?usp=sharing&ouid=109540323021403462314&rtpof=true&sd=true слайды]
+
Сборка генома  [https://docs.google.com/presentation/d/16sZRHNNLHTl8FSH5GXlwgHwLNN_jJro0/edit?usp=sharing&ouid=109540323021403462314&rtpof=true&sd=true слайды] [https://disk.yandex.ru/i/HF46XKDfPQSwxg видео]
 
||
 
||
 
'''ДЗ1''' Сборка генома [https://docs.google.com/document/d/1crbL0gFkk2kBEFMSB9gfqFCCE1LeV9wf61u3l0Q2ADo/edit?usp=sharing текст]
 
'''ДЗ1''' Сборка генома [https://docs.google.com/document/d/1crbL0gFkk2kBEFMSB9gfqFCCE1LeV9wf61u3l0Q2ADo/edit?usp=sharing текст]
Строка 37: Строка 37:
 
|| 28.09
 
|| 28.09
 
||
 
||
Алгоритмы предсказания генов [https://docs.google.com/presentation/d/17Ls3CJf72FO4CIr_opALrZK4X3aYbGI1/edit?usp=sharing&ouid=109540323021403462314&rtpof=true&sd=true слайды]
+
Алгоритмы предсказания генов [https://docs.google.com/presentation/d/17Ls3CJf72FO4CIr_opALrZK4X3aYbGI1/edit?usp=sharing&ouid=109540323021403462314&rtpof=true&sd=true слайды][https://disk.yandex.ru/i/HNzi6StDoIE9wg видео]
  
 
||
 
||

Версия 13:42, 5 октября 2023

Модули 1 и 2 - Анализ данных секвенирования

Формула расчет оценки

Накоп = Округление( (ДЗ1+ДЗ2+ДЗ3+ДЗ4+ДЗ5+квиз)/6 )
Студент имеет право зачесть Накоп в качестве итоговой оценки, не приходя на экзамен.
В случае сдачи экзамена к оценке Накоп добавляется 0.3*Э. Экзамен письменный, оценивается по 10-бальной шкале

Лекции и семинары

Это примерный план, будут изменения.


# Дата Лекция (11:10 - 12:30) Семинар (12:40 - 14:00)
1 07.09

Введение в молекулярную биологию презентация видео

Создание аккаунтов на серверах инструкция

2 14.09

Методы секвенирования ДНК слайды видео

Введение в github и Google colab команды с занятия
3 21.09

Сборка генома слайды видео

ДЗ1 Сборка генома текст

4 28.09

Алгоритмы предсказания генов слайдывидео

Алгоритмы предсказания генов. Практика

5 05.10

Аннотация функций генов

ДЗ2 Аннотация генома

6 12.10

Сдвиг рамки считывания

Семинар

7 19.10

Генная инженерия

ДЗ3 Предсказание генов

Сессия
8

Геном человека и некодирующие РНК

Повторы в геноме человека

9

Введение в РНК-сек

ДЗ4 РНК-сек

-
10

Анализ данных РНК-сек

Анализ данных РНК-сек

11

Проверочная работа по теме РНК-сек

ДЗ5 single cell РНК-сек

12

Секвенирование отдельных клеток

GWAS и популяционная генетика
13

Развитие жизни на Земле

Разбор оценок за все ДЗ
14 Экзамен