Майнор Биоинформатика 2 год 2023/24 — различия между версиями

Материал из Wiki - Факультет компьютерных наук
Перейти к: навигация, поиск
(создана страница курса)
 
м
Строка 17: Строка 17:
 
|| 07.09
 
|| 07.09
 
||
 
||
Введение в молекулярную биологию  
+
Введение в молекулярную биологию [https://docs.google.com/presentation/d/1v67ofTbXs1zwCHXLeEO5foQRt2qFtUSs/edit?usp=sharing&ouid=109540323021403462314&rtpof=true&sd=true презентация]
 
||
 
||
Создание аккаунтов на серверах  
+
Создание аккаунтов на серверах [https://eduhseru-my.sharepoint.com/:p:/g/personal/dkonovalov_hse_ru/ETv2W6XIVMlHhCkRYuBjbQsB7-tWr1pA3FrV9tZ7aip7OQ?e=IMwjTw инструкция]
 
|-
 
|-
 
| 2
 
| 2

Версия 19:09, 13 сентября 2023

Модули 1 и 2 - Анализ данных секвенирования

Формула расчет оценки

Накоп = Округление( (ДЗ1+ДЗ2+ДЗ3+ДЗ4+ДЗ5+квиз)/6 )
Студент имеет право зачесть Накоп в качестве итоговой оценки, не приходя на экзамен.
В случае сдачи экзамена к оценке Накоп добавляется 0.3*Э. Экзамен письменный, оценивается по 10-бальной шкале

Лекции и семинары

Это примерный план, будут изменения.


# Дата Лекция (11:10 - 12:30) Семинар (12:40 - 14:00)
1 07.09

Введение в молекулярную биологию презентация

Создание аккаунтов на серверах инструкция

2 14.09

Методы секвенирования ДНК

Введение в github и Google colab
3 21.09

Сборка генома

ДЗ1 Сборка генома

4 28.09

Алгоритмы предсказания генов

Разбор домашнего задания 1

5 05.10

Аннотация функций генов

ДЗ2 Аннотация генома

6 12.10

Сдвиг рамки считывания

Семинар

7 19.10

Генная инженерия

ДЗ3 Предсказание генов

Сессия
8

Геном человека и некодирующие РНК

Повторы в геноме человека

9

Введение в РНК-сек

ДЗ4 РНК-сек

-
10

Анализ данных РНК-сек

Анализ данных РНК-сек

11

Проверочная работа по теме РНК-сек

ДЗ5 single cell РНК-сек

12

Секвенирование отдельных клеток

GWAS и популяционная генетика
13

Развитие жизни на Земле

Разбор оценок за все ДЗ
14 Экзамен