Майнор Биоинформатика 2 год 2022/23

Материал из Wiki - Факультет компьютерных наук
Перейти к: навигация, поиск

Телеграм группа курса

Модули 1 и 2 - Анализ данных секвенирования

Формула расчет оценки

Накоп = Округление( (ДЗ1+ДЗ2+ДЗ3+ДЗ4+ДЗ5+ДЗ6)/6 )
Если Накоп >=6, то студент может получить Накоп в качестве итоговой оценки, не приходя на экзамен.
В случае сдачи экзамена к оценке Накоп добавляется 0.3*Э. Экзамен письменный, оценивается по 10-бальной шкале

Лекции и семинары

Записи всех лекций и семинаров

# Дата Лекция (11:10 - 12:30) Семинар (12:40 - 14:00)
1 08.09

Введение в молекулярную биологию -- видео, слайды

Создание аккаунтов на серверах -- Инструкция 1, Инструкция 2, Таблица

2 15.09

Методы секвенирования ДНК -- видео, слайды

Введение в github и Google colab
3 22.09

Сборка генома (Артем Касьянов) -- видео, слайды

ДЗ1 Сборка генома (Дмитрий Меньщиков) -- видео, Инструкция

4 29.09

Алгоритмы предсказания генов -- видео, слайды

Разбор домашнего задания -- видео, слайды

5 06.10 Аннотация функций генов ДЗ2 Аннотация генома (Иван Геворков) --инструкция
6 13.10 Сдвиг рамки считывания Библиотека Biopython и формат GenBank
7 20.10 Генная инженерия (Анатолий Зубрицкий) ДЗ3 Генная инженерия и ПЦР
27.10 Сессия
- TBA Экспериментальные аспекты секвенирования ДНК (Анатолий Зубрицкий)
8 03.11 - -
9 10.11 - ДЗ4 РНК-сек (Дмитрий Бушнев)
10 17.11 Некодирующие РНК
11 24.11 - ДЗ5 single cell РНК-сек (Егор Фурсов)
12 01.12 -
13 08.12 - ДЗ6
14 15.12 - -
15 22.12 - -
16 29.12 Экзамен -