Майнор Биоинформатика 2 год 2022/23 — различия между версиями
Материал из Wiki - Факультет компьютерных наук
м |
(→Лекции и семинары) |
||
| Строка 54: | Строка 54: | ||
[https://drive.google.com/file/d/1XId9DdtndZqzcOlUt519KuFh6GbDbTLv/view?usp=sharing слайды] | [https://drive.google.com/file/d/1XId9DdtndZqzcOlUt519KuFh6GbDbTLv/view?usp=sharing слайды] | ||
|| | || | ||
| − | Разбор домашнего задания -- | + | Разбор домашнего задания 1 -- |
[https://youtu.be/hfV4x24tGVc видео], | [https://youtu.be/hfV4x24tGVc видео], | ||
[https://drive.google.com/file/d/1XNE-HZz5uUssyxvM290d6x--iG2rhNnl/view?usp=sharing слайды] | [https://drive.google.com/file/d/1XNE-HZz5uUssyxvM290d6x--iG2rhNnl/view?usp=sharing слайды] | ||
| Строка 60: | Строка 60: | ||
| 5 | | 5 | ||
|| 06.10 | || 06.10 | ||
| − | || Аннотация функций генов | + | || |
| − | || '''ДЗ2''' Аннотация генома (Иван Геворков) --[https://colab.research.google.com/drive/12XnH8WmwZ8gz4o4rDLNrJB0XuIAL72Hr?usp=sharing ноутбук],[https://docs.google.com/document/d/1hDFQYynGaRw43X5QlyPbMek5DDHvKFvzIJZJfSZnjWk/edit инструкция] | + | Аннотация функций генов -- |
| + | [https://drive.google.com/file/d/1bO7e7TvNavHUsBXMAn5NjVwPvsJ_m2dM/view?usp=sharing слайды] | ||
| + | || | ||
| + | '''ДЗ2''' Аннотация генома (Иван Геворков) -- | ||
| + | [https://colab.research.google.com/drive/12XnH8WmwZ8gz4o4rDLNrJB0XuIAL72Hr?usp=sharing ноутбук], | ||
| + | [https://docs.google.com/document/d/1hDFQYynGaRw43X5QlyPbMek5DDHvKFvzIJZJfSZnjWk/edit инструкция] | ||
|- | |- | ||
| 6 | | 6 | ||
|| 13.10 | || 13.10 | ||
|| Сдвиг рамки считывания | || Сдвиг рамки считывания | ||
| − | || | + | || Подготовка к домашнему заданию 3 (Егор Фурсов) |
|- | |- | ||
| 7 | | 7 | ||
|| 20.10 | || 20.10 | ||
|| Генная инженерия (Анатолий Зубрицкий) | || Генная инженерия (Анатолий Зубрицкий) | ||
| − | || '''ДЗ3''' | + | || '''ДЗ3''' Алгоритм ''ab initio'' предсказания генов (Дмитрий Бушнев) |
|- | |- | ||
| | | | ||
| Строка 109: | Строка 114: | ||
|| 08.12 | || 08.12 | ||
|| - | || - | ||
| − | || '''ДЗ6''' | + | || '''ДЗ6''' Генная инженерия и ПЦР? |
|- | |- | ||
| 14 | | 14 | ||
Версия 14:29, 6 октября 2022
Модули 1 и 2 - Анализ данных секвенирования
Формула расчет оценки
Накоп = Округление( (ДЗ1+ДЗ2+ДЗ3+ДЗ4+ДЗ5+ДЗ6)/6 ) Если Накоп >=6, то студент может получить Накоп в качестве итоговой оценки, не приходя на экзамен. В случае сдачи экзамена к оценке Накоп добавляется 0.3*Э. Экзамен письменный, оценивается по 10-бальной шкале
Лекции и семинары
Записи всех лекций и семинаров
| # | Дата | Лекция (11:10 - 12:30) | Семинар (12:40 - 14:00) |
|---|---|---|---|
| 1 | 08.09 |
Создание аккаунтов на серверах -- Инструкция 1, Инструкция 2, Таблица | |
| 2 | 15.09 | Введение в github и Google colab | |
| 3 | 22.09 |
ДЗ1 Сборка генома (Дмитрий Меньщиков) -- видео, Инструкция | |
| 4 | 29.09 | ||
| 5 | 06.10 |
Аннотация функций генов -- слайды |
ДЗ2 Аннотация генома (Иван Геворков) -- ноутбук, инструкция |
| 6 | 13.10 | Сдвиг рамки считывания | Подготовка к домашнему заданию 3 (Егор Фурсов) |
| 7 | 20.10 | Генная инженерия (Анатолий Зубрицкий) | ДЗ3 Алгоритм ab initio предсказания генов (Дмитрий Бушнев) |
| 27.10 | Сессия | ||
| - | TBA | Экспериментальные аспекты секвенирования ДНК (Анатолий Зубрицкий) | |
| 8 | 03.11 | - | - |
| 9 | 10.11 | - | ДЗ4 РНК-сек (Дмитрий Бушнев) |
| 10 | 17.11 | Некодирующие РНК | |
| 11 | 24.11 | - | ДЗ5 single cell РНК-сек (Егор Фурсов) |
| 12 | 01.12 | - | |
| 13 | 08.12 | - | ДЗ6 Генная инженерия и ПЦР? |
| 14 | 15.12 | - | - |
| 15 | 22.12 | - | - |
| 16 | 29.12 | Экзамен | - |
