Майнор Биоинформатика 2 год 2022/23 — различия между версиями

Материал из Wiki - Факультет компьютерных наук
Перейти к: навигация, поиск
м (Лекции и семинары)
м (Лекции и семинары)
Строка 87: Строка 87:
 
|| 27.10
 
|| 27.10
 
!scope="row" colspan="2"| Сессия
 
!scope="row" colspan="2"| Сессия
|-
 
| -
 
|| TBA
 
|colspan="2" style="text-align: center;"| Экспериментальные аспекты секвенирования ДНК (Анатолий Зубрицкий)
 
 
|-
 
|-
 
| 8
 
| 8
 
|| 03.11
 
|| 03.11
|| -
+
||
|| Разбор домашнего задания 3?
+
Геном человека и некодирующие РНК --
 +
[https://docs.google.com/presentation/d/1BT0BrLQsqlSIdN2xct8FfKJNIjF0Mp_F/edit#slide=id.p25 2021_fall_day08]
 +
||
 +
Повторы в геноме человека (Дмитрий Коновалов?) --
 +
[https://colab.research.google.com/drive/1L5a1bI-mA4Jat_HmU2vcDkUz1MUSI72n 2021_fall_day09]
 
|-
 
|-
 
| 9
 
| 9
Строка 104: Строка 104:
 
| 10
 
| 10
 
|| 17.11
 
|| 17.11
||
+
|colspan="2" style="text-align: center;"| Экспериментальные аспекты секвенирования ДНК (Анатолий Зубрицкий)?
Геном человека и некодирующие РНК --
+
[https://docs.google.com/presentation/d/1BT0BrLQsqlSIdN2xct8FfKJNIjF0Mp_F/edit#slide=id.p25 2021_fall_day08]
+
||
+
Исследование повторов в геноме человека --
+
[https://colab.research.google.com/drive/1L5a1bI-mA4Jat_HmU2vcDkUz1MUSI72n 2021_fall_day09]
+
 
|-
 
|-
 
| 11
 
| 11

Версия 18:41, 19 октября 2022

Телеграм группа курса

Модули 1 и 2 - Анализ данных секвенирования

Формула расчет оценки

Накоп = Округление( (ДЗ1+ДЗ2+ДЗ3+ДЗ4+ДЗ5+ДЗ6)/6 )
Если Накоп >=6, то студент может получить Накоп в качестве итоговой оценки, не приходя на экзамен.
В случае сдачи экзамена к оценке Накоп добавляется 0.3*Э. Экзамен письменный, оценивается по 10-бальной шкале

Лекции и семинары

Записи всех лекций и семинаров

# Дата Лекция (11:10 - 12:30) Семинар (12:40 - 14:00)
1 08.09

Введение в молекулярную биологию -- видео, слайды

Создание аккаунтов на серверах -- Инструкция 1, Инструкция 2, Таблица

2 15.09

Методы секвенирования ДНК -- видео, слайды

Введение в github и Google colab
3 22.09

Сборка генома (Артем Касьянов) -- видео, слайды

ДЗ1 Сборка генома (Дмитрий Меньщиков) -- видео, Инструкция

4 29.09

Алгоритмы предсказания генов -- видео, слайды

Разбор домашнего задания 1 -- видео, слайды

5 06.10

Аннотация функций генов -- видео, слайды

ДЗ2 Аннотация генома (Иван Геворков) -- видео, тетрадка, инструкция

6 13.10

Сдвиг рамки считывания -- слайды

Подготовка к домашнему заданию 3 (Егор Фурсов) -- тетрадка

7 20.10 Генная инженерия (Анатолий Зубрицкий) ДЗ3 Алгоритм ab initio предсказания генов (Дмитрий Бушнев)
27.10 Сессия
8 03.11

Геном человека и некодирующие РНК -- 2021_fall_day08

Повторы в геноме человека (Дмитрий Коновалов?) -- 2021_fall_day09

9 10.11 Введение в РНК-сек ДЗ4 РНК-сек (Дмитрий Бушнев)
10 17.11 Экспериментальные аспекты секвенирования ДНК (Анатолий Зубрицкий)?
11 24.11 Секвенирование отдельных клеток ДЗ5 single cell РНК-сек (Егор Фурсов)
12 01.12 - Создание файла .vcf?
13 08.12 Популяционная генетика ДЗ6 Создание генетического паспорта?
14 15.12 Древняя ДНК -
15 22.12

Развитие жизни на Земле -- 2021_fall_day06

Ответы на вопросы по оценкам за ДЗ?
16 29.12 Экзамен -