Майнор Биоинформатика 1 год — различия между версиями

Материал из Wiki - Факультет компьютерных наук
Перейти к: навигация, поиск
(Новая страница: «'''Часть 1. Биоинформатика ДНК, РНК и белков (модули 1-2)''' <nowiki>В курсе «Элементарная гено…»)
 
Строка 9: Строка 9:
  
  
'''<big>Лекции</big>'''
+
'''<big>Лекции и семинары</big>'''
  
 
'''Лекция 0.''' Организационная. Начало Лекции 1.
 
'''Лекция 0.''' Организационная. Начало Лекции 1.
Строка 16: Строка 16:
 
Клетка, геном, белки, поток информации, генетический код. <br />
 
Клетка, геном, белки, поток информации, генетический код. <br />
 
[https://drive.google.com/open?id=1SEOTQyumGUff8Bwu54skDpu0ts38PfMG презентация]
 
[https://drive.google.com/open?id=1SEOTQyumGUff8Bwu54skDpu0ts38PfMG презентация]
 +
 +
'''Семинар 1''' Базы данных геномов бактерий.  Файлы аннотации геномов генами. Стренды.<br />
 +
[https://drive.google.com/file/d/1dHBtuFLZ6A82C7PcY_8KJTLUu-RYXvv2/view?usp=sharing содержание]
 +
 +
  
 
'''Лекция 2.''' Организация геномов прокариот и эукариот. Гены и регуляторные элементы.  
 
'''Лекция 2.''' Организация геномов прокариот и эукариот. Гены и регуляторные элементы.  
 
Белок-кодирующие и РНК-кодирующие гены. Экзоны и интроны. Сплайсинг. Промоторы и энхансеры.<br />
 
Белок-кодирующие и РНК-кодирующие гены. Экзоны и интроны. Сплайсинг. Промоторы и энхансеры.<br />
 
[https://drive.google.com/open?id=1ztbsYvKollDlx81Wd5ovTpsyn9_CB9DV презентация]
 
[https://drive.google.com/open?id=1ztbsYvKollDlx81Wd5ovTpsyn9_CB9DV презентация]
 +
 +
'''Семинар 2.''' Введение в систему Unix. Основные команды Unix. Файловая система. Навигация. Командная строка. Просмотр файлов. Bash-скрипты.<br />
 +
[https://drive.google.com/file/d/1SeCPSKKS6u8yQm33GBeHpa54z8kOp3-L/view?usp=sharing содержание] [https://drive.google.com/drive/folders/15GE3CiAMLPR8VfpkdOWdTJt_gDEeX0nx?usp=sharing данные]

Версия 10:17, 16 сентября 2020

Часть 1. Биоинформатика ДНК, РНК и белков (модули 1-2)


В курсе «Элементарная геномика» изучаются основные закономерности молекулярной эволюции и математические методы анализа молекулярных последовательностей, включая алгоритмы поиска гомологичных последовательностей, выравнивания последовательностей и построения филогенетических деревьев, алгоритмы поиска ортологов и горизонтально перенесенных генов, предсказания генов и поиск мотивов, методы аннотации геномов de novo генами и функциональными элементами. Изучаются алгоритмы и методы предсказания вторичной структуры ДНК, РНК и белков.

В течение курса студенты познакомятся с основными биоинформатическими ресурсами, включая базы данных, веб-порталы, компьютерные программы для работы с базами данных молекулярной биологии, а также программами, реализующими биоинформатические методы.



Лекции и семинары

Лекция 0. Организационная. Начало Лекции 1.

Лекция 1. Введение. Основы молекулярной биологии. Клетка, геном, белки, поток информации, генетический код.
презентация

Семинар 1 Базы данных геномов бактерий. Файлы аннотации геномов генами. Стренды.
содержание


Лекция 2. Организация геномов прокариот и эукариот. Гены и регуляторные элементы. Белок-кодирующие и РНК-кодирующие гены. Экзоны и интроны. Сплайсинг. Промоторы и энхансеры.
презентация

Семинар 2. Введение в систему Unix. Основные команды Unix. Файловая система. Навигация. Командная строка. Просмотр файлов. Bash-скрипты.
содержание данные