Майнор Биоинформатика 2 год 2022/23

Модули 3 и 4 - Введение в эпигеномику

Формула расчет оценки

Накоп = Округление(0.5*ДЗ  +  0.5*ПРОЕКТ)
ДЗ = (ДЗ1+ДЗ2+ДЗ3+ДЗ4)/4
ПРОЕКТ = 0.7*Инд_часть + 0.3*Групповая_часть

Если Накоп >=6, то студент может получить Накоп в качестве итоговой оценки, не приходя на экзамен.
В случае сдачи экзамена к оценке Накоп добавляется 0.3*Э.
Экзамен письменный, оценивается по 10-бальной шкале

Лекции и семинары

#	Дата	Лекция (11:10 - 12:30)	Семинар (12:40 - 14:00)
1	19.01	Введение в эпигеномику	Формат .bed и утилита bedtools
2	26.01	TBA	TBA
3	02.02	TBA	TBA
4	09.02	TBA	TBA
5	16.02	TBA	TBA
6	02.03	TBA	TBA
7	09.03	TBA	TBA
8	16.03	TBA	TBA
9	23.03	TBA	TBA
10	06.04	TBA	TBA
11	13.04	TBA	TBA
12	20.04	TBA	TBA
13	27.04	TBA	TBA

Модули 1 и 2 - Анализ данных секвенирования

Формула расчет оценки

Накоп = Округление( (ДЗ1+ДЗ2+ДЗ3+ДЗ4+ДЗ5+квиз)/6 )
Студент имеет право зачесть Накоп в качестве итоговой оценки, не приходя на экзамен.
В случае сдачи экзамена к оценке Накоп добавляется 0.3*Э. Экзамен письменный, оценивается по 10-бальной шкале

Лекции и семинары

Записи всех лекций и семинаров

#	Дата	Лекция (11:10 - 12:30)	Семинар (12:40 - 14:00)
1	08.09	Введение в молекулярную биологию -- видео, слайды	Создание аккаунтов на серверах -- Инструкция 1, Инструкция 2, Таблица
2	15.09	Методы секвенирования ДНК -- видео, слайды	Введение в github и Google colab
3	22.09	Сборка генома (Артем Касьянов) -- видео, слайды	ДЗ1 Сборка генома (Дмитрий Меньщиков) -- видео, задание
4	29.09	Алгоритмы предсказания генов -- видео, слайды	Разбор домашнего задания 1 -- видео, слайды
5	06.10	Аннотация функций генов -- видео, слайды	ДЗ2 Аннотация генома (Иван Геворков) -- видео, тетрадка, задание
6	13.10	Сдвиг рамки считывания -- видео, слайды	Подготовка к домашнему заданию 3 (Егор Фурсов) -- видео, тетрадка
7	20.10	Генная инженерия (Анатолий Зубрицкий) -- видео, слайды	ДЗ3 Предсказание генов (Дмитрий Бушнев) -- видео, тетрадка, задание
	27.10	Сессия
8	03.11	Геном человека и некодирующие РНК -- видео, слайды	Повторы в геноме человека (Дмитрий Коновалов) -- видео, тетрадка
9	10.11	Введение в РНК-сек (Анатолий Зубрицкий) -- видео, слайды	ДЗ4 РНК-сек (Дмитрий Бушнев) -- видео, задание
	17.11	-
10	24.11	Анализ данных РНК-сек -- видео, слайды	Анализ данных РНК-сек -- видео, слайды
11	01.12	Проверочная работа по теме РНК-сек	ДЗ5 single cell РНК-сек (Егор Фурсов) -- видео, слайды, задание
12	08.12	Секвенирование отдельных клеток (Анатолий Зубрицкий) -- слайды	GWAS и популяционная генетика
13	15.12	Развитие жизни на Земле -- слайды	Разбор оценок за все ДЗ
14	22.12	Экзамен