Майнор Биоинформатика 2 год 2023/24

Материал из Wiki - Факультет компьютерных наук
Перейти к: навигация, поиск

Модули 1 и 2 - Анализ данных секвенирования

Формула расчет оценки

Накоп = Округление( (ДЗ1+ДЗ2+ДЗ3+ДЗ4+ДЗ5+квиз)/6 )
Студент имеет право зачесть Накоп в качестве итоговой оценки, не приходя на экзамен.
В случае сдачи экзамена к оценке Накоп добавляется 0.3*Э. Экзамен письменный, оценивается по 10-бальной шкале

Лекции и семинары

Это примерный план, будут изменения.


# Дата Лекция (11:10 - 12:30) Семинар (12:40 - 14:00)
1 07.09

Введение в молекулярную биологию презентация

Создание аккаунтов на серверах инструкция

2 14.09

Методы секвенирования ДНК

Введение в github и Google colab
3 21.09

Сборка генома

ДЗ1 Сборка генома

4 28.09

Алгоритмы предсказания генов

Разбор домашнего задания 1

5 05.10

Аннотация функций генов

ДЗ2 Аннотация генома

6 12.10

Сдвиг рамки считывания

Семинар

7 19.10

Генная инженерия

ДЗ3 Предсказание генов

Сессия
8

Геном человека и некодирующие РНК

Повторы в геноме человека

9

Введение в РНК-сек

ДЗ4 РНК-сек

-
10

Анализ данных РНК-сек

Анализ данных РНК-сек

11

Проверочная работа по теме РНК-сек

ДЗ5 single cell РНК-сек

12

Секвенирование отдельных клеток

GWAS и популяционная генетика
13

Развитие жизни на Земле

Разбор оценок за все ДЗ
14 Экзамен