Майнор Биоинформатика 2 год 2022/23
Материал из Wiki - Факультет компьютерных наук
Версия от 12:44, 13 октября 2022; Ivan antonov (обсуждение | вклад)
Модули 1 и 2 - Анализ данных секвенирования
Формула расчет оценки
Накоп = Округление( (ДЗ1+ДЗ2+ДЗ3+ДЗ4+ДЗ5+ДЗ6)/6 ) Если Накоп >=6, то студент может получить Накоп в качестве итоговой оценки, не приходя на экзамен. В случае сдачи экзамена к оценке Накоп добавляется 0.3*Э. Экзамен письменный, оценивается по 10-бальной шкале
Лекции и семинары
Записи всех лекций и семинаров
| # | Дата | Лекция (11:10 - 12:30) | Семинар (12:40 - 14:00) |
|---|---|---|---|
| 1 | 08.09 |
Создание аккаунтов на серверах -- Инструкция 1, Инструкция 2, Таблица | |
| 2 | 15.09 | Введение в github и Google colab | |
| 3 | 22.09 |
ДЗ1 Сборка генома (Дмитрий Меньщиков) -- видео, Инструкция | |
| 4 | 29.09 | ||
| 5 | 06.10 |
ДЗ2 Аннотация генома (Иван Геворков) -- видео, ноутбук, инструкция | |
| 6 | 13.10 |
Сдвиг рамки считывания -- слайды |
Подготовка к домашнему заданию 3 (Егор Фурсов) |
| 7 | 20.10 | Генная инженерия (Анатолий Зубрицкий) | ДЗ3 Алгоритм ab initio предсказания генов (Дмитрий Бушнев) |
| 27.10 | Сессия | ||
| - | TBA | Экспериментальные аспекты секвенирования ДНК (Анатолий Зубрицкий) | |
| 8 | 03.11 | - | Разбор домашнего задания 3? |
| 9 | 10.11 | Введение в РНК-сек | ДЗ4 РНК-сек (Дмитрий Бушнев) |
| 10 | 17.11 |
Геном человека и некодирующие РНК -- 2021_fall_day08 |
Исследование повторов в геноме человека -- 2021_fall_day09 |
| 11 | 24.11 | Секвенирование отдельных клеток | ДЗ5 single cell РНК-сек (Егор Фурсов) |
| 12 | 01.12 | - | Создание файла .vcf? |
| 13 | 08.12 | Популяционная генетика | ДЗ6 Создание генетического паспорта? |
| 14 | 15.12 | Древняя ДНК | - |
| 15 | 22.12 |
Развитие жизни на Земле -- 2021_fall_day06 |
Ответы на вопросы по оценкам за ДЗ? |
| 16 | 29.12 | Экзамен | - |
