Моделирование пространственной структуры РНК ()
Содержание
Что это за проект?
Мы сформулировали и применили свой подход к реконструкции пространственной структуры РНК на основе данных о вторичной структуре и дополнительных дистанционных ограничений, который показал хорошие результаты при сравнении с полученными позже экспериментальными данными. После публикации статьи мы сделали веб-сервис, реализующий этот подход, однако он уже порядком устарел и мы хотели бы его существенно улучшить, как с точки зрения науки, так и качества реализации.
Чему вы научитесь?
- Познакомитесь с пространственными структурами различных биомолекул.
- Приобретете опыт по разработке веб-сервисов научной направленности.
Какие начальные требования?
- Желание разобраться в структурном многообразии нуклеиновых кислот.
- Желание создать научный веб-сервис
- Базовые знания ОС GNU/Linux.
- Базовые знания Shell, Python.
Какие будут использоваться технологии?
Темы вводных занятий
- Нуклеиновые кислоты, связь структура - функция.
Направления развития
- Реализовать рассылку почтовых уведомлений о выполнении задачи;
- Реализовать ограниченный доступ к выдаче и файлам задачи;
- Реализовать интерактивную страницу с очередью и состоянием задачи;
- Реализовать визуализацию 3D структур биомолекул на странице с выдачей результатов.
Критерии оценки
4-5 Переработать существующий протопип, реализовать базовую функциональность фронтэнда (загрузку данных, выдачу результата);
6-7 Реализовать ограничения доступа;
8-10 Реализовать интерактивную страницу с очередью и состоянием задачи. Реализовать визуализацию 3D структур РНК на странице с выдачей результатов.
