Майнор Биоинформатика 2 год 2024/25 — различия между версиями
Материал из Wiki - Факультет компьютерных наук
м (→Лекции и семинары) |
м (→Лекции и семинары) |
||
| Строка 44: | Строка 44: | ||
Аннотация функций генов [https://docs.google.com/presentation/d/1Ct7lvWRWiPuKaRBDKtxHM5E4sXEN-LGN/edit?usp=sharing&ouid=109540323021403462314&rtpof=true&sd=true слайды] | Аннотация функций генов [https://docs.google.com/presentation/d/1Ct7lvWRWiPuKaRBDKtxHM5E4sXEN-LGN/edit?usp=sharing&ouid=109540323021403462314&rtpof=true&sd=true слайды] | ||
|| | || | ||
| − | '''ДЗ2''' Аннотация генома | + | '''ДЗ2''' Аннотация генома [https://docs.google.com/document/d/1IVYr_tCQwJmstoXm8Mzs5P6qYLWrTOJhiN8u3Fn7ZX0/edit?usp=sharing текст] |
|- | |- | ||
| 6 | | 6 | ||
|| 10.10 | || 10.10 | ||
|| | || | ||
| − | Сдвиг рамки считывания | + | Сдвиг рамки считывания [https://docs.google.com/presentation/d/1yQgQUQm-kwYxZLXSIPgoiHlNZWUjsupa/edit?usp=sharing&ouid=109540323021403462314&rtpof=true&sd=true слайды] |
|| | || | ||
Семинар | Семинар | ||
| Строка 58: | Строка 58: | ||
Геном человека и некодирующие РНК | Геном человека и некодирующие РНК | ||
|| | || | ||
| − | '''ДЗ3''' Предсказание генов | + | '''ДЗ3''' Предсказание генов [https://docs.google.com/document/d/1Z7D_lD1XCBrbj-3xcvW1klgtN96ks-AbGPae_vMGAtQ/edit?usp=sharing текст] |
|- | |- | ||
| | | | ||
| Строка 67: | Строка 67: | ||
|| 31.10 | || 31.10 | ||
|| | || | ||
| − | Введение в РНК-сек | + | Введение в РНК-сек [https://docs.google.com/presentation/d/12j8h7g6biR1L28TXsN8K3I2kuSpBC4Uy/edit?usp=sharing&ouid=109540323021403462314&rtpof=true&sd=true слайды] |
|| | || | ||
'''ДЗ4''' РНК-сек | '''ДЗ4''' РНК-сек | ||
Версия 12:28, 24 октября 2024
Модули 1 и 2 - Анализ данных секвенирования
Формула расчет оценки
Накоп = Округление( Среднее(ДЗ1+ДЗ2+ДЗ3+ДЗ4+ДЗ5+квиз)*0.8 ) Студент имеет право зачесть Накоп в качестве итоговой оценки, не приходя на экзамен. В случае сдачи экзамена к оценке Накоп добавляется 0.3*Э. Экзамен письменный, оценивается по 10-бальной шкале
Лекции и семинары
| # | Дата | Лекция (11:10 - 12:30) | Семинар (12:40 - 14:00) |
|---|---|---|---|
| 1 | 05.09 |
Введение в молекулярную биологию лекция |
Создание аккаунтов на серверах инструкция |
| 2 | 12.09 |
Методы секвенирования ДНК лекция |
Введение в github и Google colab. Sra toolkit тетрадка |
| 3 | 19.09 |
Сборка генома слайды |
ДЗ1 Сборка генома текст |
| 4 | 26.09 |
Алгоритмы предсказания генов слайды |
Алгоритмы предсказания генов. Практика |
| 5 | 03.10 |
Аннотация функций генов слайды |
ДЗ2 Аннотация генома текст |
| 6 | 10.10 |
Сдвиг рамки считывания слайды |
Семинар |
| 7 | 24.10 |
Геном человека и некодирующие РНК |
ДЗ3 Предсказание генов текст |
| Сессия | |||
| 8 | 31.10 |
Введение в РНК-сек слайды |
ДЗ4 РНК-сек |
| 9 | 07.11 |
Анализ данных РНК-сек |
Анализ данных РНК-сек |
| 11 | 14.11 |
Секвенирование отдельных клеток [ |
ДЗ5 single cell РНК-сек |
| 12 | 21.11 | Проверочная работа по теме РНК-сек | Разбор ДЗ5 single cell РНК-сек |
| 13 | 28.11 | GWAS | GWAS |
| 14 | 05.12 | Метагеномика. Лекция | Семинар |
| 15 | 12.12 | Заключение | Заключение. Дописывание квиза. |
| 16 | 19.12 | Экзамен | |
