Майнор Биоинформатика 2 год 2022/23 — различия между версиями
Материал из Wiki - Факультет компьютерных наук
(→Лекции и семинары) |
(→Лекции и семинары) |
||
| Строка 118: | Строка 118: | ||
'''[https://docs.google.com/document/d/1em3ictlXzfacZqaG5Rn5i3QAnvNlT-eKPP4yV24_8M4/edit?usp=sharing задание]''' | '''[https://docs.google.com/document/d/1em3ictlXzfacZqaG5Rn5i3QAnvNlT-eKPP4yV24_8M4/edit?usp=sharing задание]''' | ||
|- | |- | ||
| − | | | + | | |
|| 17.11 | || 17.11 | ||
|colspan="2" style="text-align: center;"| - | |colspan="2" style="text-align: center;"| - | ||
|- | |- | ||
| − | | | + | | 10 |
|| 24.11 | || 24.11 | ||
|| Анализ данных РНК-сек | || Анализ данных РНК-сек | ||
|| Анализ данных РНК-сек | || Анализ данных РНК-сек | ||
|- | |- | ||
| − | | | + | | 11 |
|| 01.12 | || 01.12 | ||
|| Секвенирование отдельных клеток (Анатолий Зубрицкий?) | || Секвенирование отдельных клеток (Анатолий Зубрицкий?) | ||
|| '''ДЗ5''' single cell РНК-сек (Егор Фурсов) | || '''ДЗ5''' single cell РНК-сек (Егор Фурсов) | ||
|- | |- | ||
| − | | | + | | 12 |
|| 08.12 | || 08.12 | ||
|| GWAS и популяционная генетика, Создание файла .vcf? | || GWAS и популяционная генетика, Создание файла .vcf? | ||
|| Создание генетического паспорта? | || Создание генетического паспорта? | ||
|- | |- | ||
| − | | | + | | 13 |
|| 15.12 | || 15.12 | ||
|| Древняя ДНК | || Древняя ДНК | ||
|| - | || - | ||
|- | |- | ||
| − | | | + | | 14 |
|| 22.12 | || 22.12 | ||
|| | || | ||
| Строка 153: | Строка 153: | ||
|colspan="2" style="text-align: center;"| Экспериментальные аспекты секвенирования ДНК (Анатолий Зубрицкий) | |colspan="2" style="text-align: center;"| Экспериментальные аспекты секвенирования ДНК (Анатолий Зубрицкий) | ||
|- | |- | ||
| − | | | + | | 15 |
|| 29.12 | || 29.12 | ||
|| Экзамен | || Экзамен | ||
|| - | || - | ||
|} | |} | ||
Версия 22:22, 23 ноября 2022
Модули 1 и 2 - Анализ данных секвенирования
Формула расчет оценки
Накоп = Округление( (ДЗ1+ДЗ2+ДЗ3+ДЗ4+ДЗ5+ДЗ6)/6 ) Если Накоп >=6, то студент может получить Накоп в качестве итоговой оценки, не приходя на экзамен. В случае сдачи экзамена к оценке Накоп добавляется 0.3*Э. Экзамен письменный, оценивается по 10-бальной шкале
Лекции и семинары
Записи всех лекций и семинаров
| # | Дата | Лекция (11:10 - 12:30) | Семинар (12:40 - 14:00) |
|---|---|---|---|
| 1 | 08.09 |
Создание аккаунтов на серверах -- Инструкция 1, Инструкция 2, Таблица | |
| 2 | 15.09 | Введение в github и Google colab | |
| 3 | 22.09 | ||
| 4 | 29.09 | ||
| 5 | 06.10 |
ДЗ2 Аннотация генома (Иван Геворков) -- видео, тетрадка, задание | |
| 6 | 13.10 |
Подготовка к домашнему заданию 3 (Егор Фурсов) -- видео, тетрадка | |
| 7 | 20.10 |
ДЗ3 Предсказание генов (Дмитрий Бушнев) -- видео, тетрадка, задание | |
| 27.10 | Сессия | ||
| 8 | 03.11 |
Повторы в геноме человека (Дмитрий Коновалов) -- видео, тетрадка | |
| 9 | 10.11 |
Введение в РНК-сек (Анатолий Зубрицкий) -- видео |
|
| 17.11 | - | ||
| 10 | 24.11 | Анализ данных РНК-сек | Анализ данных РНК-сек |
| 11 | 01.12 | Секвенирование отдельных клеток (Анатолий Зубрицкий?) | ДЗ5 single cell РНК-сек (Егор Фурсов) |
| 12 | 08.12 | GWAS и популяционная генетика, Создание файла .vcf? | Создание генетического паспорта? |
| 13 | 15.12 | Древняя ДНК | - |
| 14 | 22.12 |
Развитие жизни на Земле -- 2021_fall_day06 |
Ответы на вопросы по оценкам за ДЗ? |
| Экспериментальные аспекты секвенирования ДНК (Анатолий Зубрицкий) | |||
| 15 | 29.12 | Экзамен | - |
