Майнор Биоинформатика 2 год 2022/23 — различия между версиями

Материал из Wiki - Факультет компьютерных наук
Перейти к: навигация, поиск
(→‎Лекции и семинары)
(→‎Лекции и семинары)
Строка 120: Строка 120:
 
| 10
 
| 10
 
|| 17.11
 
|| 17.11
−
|colspan="2" style="text-align: center;"| Экспериментальные аспекты секвенирования ДНК (Анатолий Зубрицкий)
+
|colspan="2" style="text-align: center;"| -
 
|-
 
|-
 
| 11
 
| 11
 
|| 24.11
 
|| 24.11
−
|| Секвенирование отдельных клеток
+
|| Анализ данных РНК-сек
−
|| '''ДЗ5''' single cell РНК-сек (Егор Фурсов)
+
|| Анализ данных РНК-сек
 
|-
 
|-
 
| 12
 
| 12
 
|| 01.12
 
|| 01.12
−
|| -
+
|| Секвенирование отдельных клеток (Анатолий Зубрицкий?)
−
|| Создание файла .vcf?
+
|| '''ДЗ5''' single cell РНК-сек (Егор Фурсов)
 
|-
 
|-
 
| 13
 
| 13
 
|| 08.12
 
|| 08.12
−
|| GWAS и популяционная генетика
+
|| GWAS и популяционная генетика, Создание файла .vcf?
−
|| '''ДЗ6''' Создание генетического паспорта?
+
|| Создание генетического паспорта?
 
|-
 
|-
 
| 14
 
| 14
Строка 148: Строка 148:
 
[https://docs.google.com/presentation/d/10kMzVKszcB4zpE6woLIt3Xfqqh_SJZDH/edit#slide=id.p1 2021_fall_day06]
 
[https://docs.google.com/presentation/d/10kMzVKszcB4zpE6woLIt3Xfqqh_SJZDH/edit#slide=id.p1 2021_fall_day06]
 
|| Ответы на вопросы по оценкам за ДЗ?
 
|| Ответы на вопросы по оценкам за ДЗ?
 +
|-
 +
|
 +
||
 +
|colspan="2" style="text-align: center;"| Экспериментальные аспекты секвенирования ДНК (Анатолий Зубрицкий)
 
|-
 
|-
 
| 16
 
| 16

Версия 22:20, 23 ноября 2022

Телеграм группа курса

Модули 1 и 2 - Анализ данных секвенирования

Формула расчет оценки

Накоп = Округление( (ДЗ1+ДЗ2+ДЗ3+ДЗ4+ДЗ5+ДЗ6)/6 )
Если Накоп >=6, то студент может получить Накоп в качестве итоговой оценки, не приходя на экзамен.
В случае сдачи экзамена к оценке Накоп добавляется 0.3*Э. Экзамен письменный, оценивается по 10-бальной шкале

Лекции и семинары

Записи всех лекций и семинаров

# Дата Лекция (11:10 - 12:30) Семинар (12:40 - 14:00)
1 08.09

Введение в молекулярную биологию -- видео, слайды

Создание аккаунтов на серверах -- Инструкция 1, Инструкция 2, Таблица

2 15.09

Методы секвенирования ДНК -- видео, слайды

Введение в github и Google colab
3 22.09

Сборка генома (Артем Касьянов) -- видео, слайды

ДЗ1 Сборка генома (Дмитрий Меньщиков) -- видео, задание

4 29.09

Алгоритмы предсказания генов -- видео, слайды

Разбор домашнего задания 1 -- видео, слайды

5 06.10

Аннотация функций генов -- видео, слайды

ДЗ2 Аннотация генома (Иван Геворков) -- видео, тетрадка, задание

6 13.10

Сдвиг рамки считывания -- видео, слайды

Подготовка к домашнему заданию 3 (Егор Фурсов) -- видео, тетрадка

7 20.10

Генная инженерия (Анатолий Зубрицкий) -- видео, слайды

ДЗ3 Предсказание генов (Дмитрий Бушнев) -- видео, тетрадка, задание

27.10 Сессия
8 03.11

Геном человека и некодирующие РНК -- видео, слайды

Повторы в геноме человека (Дмитрий Коновалов) -- видео, тетрадка

9 10.11

Введение в РНК-сек (Анатолий Зубрицкий) -- видео

ДЗ4 РНК-сек (Дмитрий Бушнев) -- видео, задание

10 17.11 -
11 24.11 Анализ данных РНК-сек Анализ данных РНК-сек
12 01.12 Секвенирование отдельных клеток (Анатолий Зубрицкий?) ДЗ5 single cell РНК-сек (Егор Фурсов)
13 08.12 GWAS и популяционная генетика, Создание файла .vcf? Создание генетического паспорта?
14 15.12 Древняя ДНК -
15 22.12

Развитие жизни на Земле -- 2021_fall_day06

Ответы на вопросы по оценкам за ДЗ?
Экспериментальные аспекты секвенирования ДНК (Анатолий Зубрицкий)
16 29.12 Экзамен -
Источник — «http://wiki.cs.hse.ru/index.php?title=Майнор_Биоинформатика_2_год_2022/23&oldid=74335»