Майнор Биоинформатика 2 год 2022/23 — различия между версиями

Материал из Wiki - Факультет компьютерных наук
Перейти к: навигация, поиск
(Лекции и семинары)
м (Лекции и семинары)
Строка 62: Строка 62:
 
||
 
||
 
Аннотация функций генов --
 
Аннотация функций генов --
 +
[https://youtu.be/hBsa_WgKwCU видео],
 
[https://drive.google.com/file/d/1bO7e7TvNavHUsBXMAn5NjVwPvsJ_m2dM/view?usp=sharing слайды]
 
[https://drive.google.com/file/d/1bO7e7TvNavHUsBXMAn5NjVwPvsJ_m2dM/view?usp=sharing слайды]
 
||
 
||
 
'''ДЗ2''' Аннотация генома (Иван Геворков) --  
 
'''ДЗ2''' Аннотация генома (Иван Геворков) --  
 +
[https://youtu.be/YKtfkmwdfJQ видео],
 
[https://colab.research.google.com/drive/12XnH8WmwZ8gz4o4rDLNrJB0XuIAL72Hr?usp=sharing ноутбук],
 
[https://colab.research.google.com/drive/12XnH8WmwZ8gz4o4rDLNrJB0XuIAL72Hr?usp=sharing ноутбук],
 
[https://docs.google.com/document/d/1hDFQYynGaRw43X5QlyPbMek5DDHvKFvzIJZJfSZnjWk/edit инструкция]
 
[https://docs.google.com/document/d/1hDFQYynGaRw43X5QlyPbMek5DDHvKFvzIJZJfSZnjWk/edit инструкция]

Версия 23:38, 12 октября 2022

Телеграм группа курса

Модули 1 и 2 - Анализ данных секвенирования

Формула расчет оценки

Накоп = Округление( (ДЗ1+ДЗ2+ДЗ3+ДЗ4+ДЗ5+ДЗ6)/6 )
Если Накоп >=6, то студент может получить Накоп в качестве итоговой оценки, не приходя на экзамен.
В случае сдачи экзамена к оценке Накоп добавляется 0.3*Э. Экзамен письменный, оценивается по 10-бальной шкале

Лекции и семинары

Записи всех лекций и семинаров

# Дата Лекция (11:10 - 12:30) Семинар (12:40 - 14:00)
1 08.09

Введение в молекулярную биологию -- видео, слайды

Создание аккаунтов на серверах -- Инструкция 1, Инструкция 2, Таблица

2 15.09

Методы секвенирования ДНК -- видео, слайды

Введение в github и Google colab
3 22.09

Сборка генома (Артем Касьянов) -- видео, слайды

ДЗ1 Сборка генома (Дмитрий Меньщиков) -- видео, Инструкция

4 29.09

Алгоритмы предсказания генов -- видео, слайды

Разбор домашнего задания 1 -- видео, слайды

5 06.10

Аннотация функций генов -- видео, слайды

ДЗ2 Аннотация генома (Иван Геворков) -- видео, ноутбук, инструкция

6 13.10 Сдвиг рамки считывания Подготовка к домашнему заданию 3 (Егор Фурсов)
7 20.10 Генная инженерия (Анатолий Зубрицкий) ДЗ3 Алгоритм ab initio предсказания генов (Дмитрий Бушнев)
27.10 Сессия
- TBA Экспериментальные аспекты секвенирования ДНК (Анатолий Зубрицкий)
8 03.11 - -
9 10.11 - ДЗ4 РНК-сек (Дмитрий Бушнев)
10 17.11 Некодирующие РНК
11 24.11 - ДЗ5 single cell РНК-сек (Егор Фурсов)
12 01.12 -
13 08.12 - ДЗ6 Генная инженерия и ПЦР?
14 15.12 - -
15 22.12 - -
16 29.12 Экзамен -