Майнор Биоинформатика 2 год 2022/23 — различия между версиями
Материал из Wiki - Факультет компьютерных наук
м (→Лекции и семинары) |
(→Лекции и семинары) |
||
| Строка 14: | Строка 14: | ||
{| class="wikitable" | {| class="wikitable" | ||
|- | |- | ||
| − | ! # !! Дата | + | ! # !! Дата !! Лекция (11:10 - 12:30) !! Семинар (12:40 - 14:00) |
|- | |- | ||
| 1 | | 1 | ||
|| 08.09 | || 08.09 | ||
| − | |||
|| | || | ||
Введение в молекулярную биологию -- | Введение в молекулярную биологию -- | ||
| + | [https://youtu.be/lvqxhF0Yfuo видео], | ||
[https://drive.google.com/file/d/1Ka_0ZNoz9sfYMnsxgu3nl84-7biACr7q/view?usp=sharing слайды] | [https://drive.google.com/file/d/1Ka_0ZNoz9sfYMnsxgu3nl84-7biACr7q/view?usp=sharing слайды] | ||
|| | || | ||
| Строка 30: | Строка 30: | ||
| 2 | | 2 | ||
|| 15.09 | || 15.09 | ||
| − | |||
|| | || | ||
Методы секвенирования ДНК -- | Методы секвенирования ДНК -- | ||
| − | [https:// | + | [https://youtu.be/JqK2EXwyDT0 видео], |
| − | [https://drive.google.com/ | + | [https://drive.google.com/file/d/1RqVQzbmJuz_8n66No_Eq0n_m1hmi8RJk/view?usp=sharing слайды] |
|| Введение в github и Google colab | || Введение в github и Google colab | ||
|- | |- | ||
| 3 | | 3 | ||
|| 22.09 | || 22.09 | ||
| − | || | + | || |
| − | + | Сборка генома (Артем Касьянов) -- | |
| + | [https://youtu.be/0X7pbcVo8ys видео], | ||
| + | [https://drive.google.com/file/d/1UrV8C8wUsAo5Z3Kq_MuuKRT6C8YokykK/view?usp=sharing слайды] | ||
|| '''Домашнее Задание 1''' - сборка генома (Дмитрий Меньщиков) [https://docs.google.com/document/d/1vpFZF5F82_xjZPXGcm-ADsh4yhiWc_sUirHaFtQGNDA/edit Инструкция] | || '''Домашнее Задание 1''' - сборка генома (Дмитрий Меньщиков) [https://docs.google.com/document/d/1vpFZF5F82_xjZPXGcm-ADsh4yhiWc_sUirHaFtQGNDA/edit Инструкция] | ||
|- | |- | ||
| 4 | | 4 | ||
|| 29.09 | || 29.09 | ||
| − | |||
|colspan="2" style="text-align: center;"| Экспериментальные аспекты секвенирования ДНК (Анатолий Зубрицкий) | |colspan="2" style="text-align: center;"| Экспериментальные аспекты секвенирования ДНК (Анатолий Зубрицкий) | ||
|- | |- | ||
| 5 | | 5 | ||
|| 06.10 | || 06.10 | ||
| − | |||
|| Аннотация генома | || Аннотация генома | ||
|| Домашнее Задание 2 - аннотация генома (Иван Геворков) | || Домашнее Задание 2 - аннотация генома (Иван Геворков) | ||
| Строка 56: | Строка 55: | ||
| 6 | | 6 | ||
|| 13.10 | || 13.10 | ||
| − | |||
|| Сдвиг рамки считывания | || Сдвиг рамки считывания | ||
|| - | || - | ||
| Строка 62: | Строка 60: | ||
| 7 | | 7 | ||
|| 20.10 | || 20.10 | ||
| − | |||
|| Генная инженерия (Анатолий Зубрицкий) | || Генная инженерия (Анатолий Зубрицкий) | ||
|| Домашнее Задание 3 - Генная инженерия и ПЦР | || Домашнее Задание 3 - Генная инженерия и ПЦР | ||
| Строка 68: | Строка 65: | ||
| | | | ||
|| 27.10 | || 27.10 | ||
| − | |||
!scope="row" colspan="2"| Сессия | !scope="row" colspan="2"| Сессия | ||
|- | |- | ||
| 8 | | 8 | ||
|| 03.11 | || 03.11 | ||
| − | |||
|| - | || - | ||
|| - | || - | ||
| Строка 79: | Строка 74: | ||
| 9 | | 9 | ||
|| 10.11 | || 10.11 | ||
| − | |||
|| - | || - | ||
|| Домашнее Задание 4 - РНК-сек (Дмитрий Бушнев) | || Домашнее Задание 4 - РНК-сек (Дмитрий Бушнев) | ||
| Строка 85: | Строка 79: | ||
| 10 | | 10 | ||
|| 17.11 | || 17.11 | ||
| − | |||
|| Некодирующие РНК | || Некодирующие РНК | ||
|| | || | ||
| Строка 91: | Строка 84: | ||
| 11 | | 11 | ||
|| 24.11 | || 24.11 | ||
| − | |||
|| - | || - | ||
|| Домашнее Задание 5 - single cell РНК-сек (Егор Фурсов) | || Домашнее Задание 5 - single cell РНК-сек (Егор Фурсов) | ||
| Строка 97: | Строка 89: | ||
| 12 | | 12 | ||
|| 01.12 | || 01.12 | ||
| − | |||
|| - | || - | ||
|| | || | ||
| Строка 103: | Строка 94: | ||
| 13 | | 13 | ||
|| 08.12 | || 08.12 | ||
| − | |||
|| - | || - | ||
|| Домашнее Задание 6 | || Домашнее Задание 6 | ||
| Строка 109: | Строка 99: | ||
| 14 | | 14 | ||
|| 15.12 | || 15.12 | ||
| − | |||
|| - | || - | ||
|| - | || - | ||
| Строка 115: | Строка 104: | ||
| 15 | | 15 | ||
|| 22.12 | || 22.12 | ||
| − | |||
|| - | || - | ||
|| - | || - | ||
| Строка 121: | Строка 109: | ||
| 16 | | 16 | ||
|| 29.12 | || 29.12 | ||
| − | |||
|| Экзамен | || Экзамен | ||
|| - | || - | ||
|} | |} | ||
Версия 17:42, 23 сентября 2022
Модули 1 и 2 - Анализ данных секвенирования
Формула расчет оценки
Накоп = Округление( (ДЗ1+ДЗ2+ДЗ3+ДЗ4+ДЗ5+ДЗ6)/6 ) Если Накоп >=6, то студент может получить Накоп в качестве итоговой оценки, не приходя на экзамен. В случае сдачи экзамена к оценке Накоп добавляется 0.3*Э. Экзамен письменный, оценивается по 10-бальной шкале
Лекции и семинары
Записи всех лекций и семинаров
| # | Дата | Лекция (11:10 - 12:30) | Семинар (12:40 - 14:00) |
|---|---|---|---|
| 1 | 08.09 |
Создание аккаунтов на серверах -- Инструкция 1, Инструкция 2, Таблица | |
| 2 | 15.09 | Введение в github и Google colab | |
| 3 | 22.09 | Домашнее Задание 1 - сборка генома (Дмитрий Меньщиков) Инструкция | |
| 4 | 29.09 | Экспериментальные аспекты секвенирования ДНК (Анатолий Зубрицкий) | |
| 5 | 06.10 | Аннотация генома | Домашнее Задание 2 - аннотация генома (Иван Геворков) |
| 6 | 13.10 | Сдвиг рамки считывания | - |
| 7 | 20.10 | Генная инженерия (Анатолий Зубрицкий) | Домашнее Задание 3 - Генная инженерия и ПЦР |
| 27.10 | Сессия | ||
| 8 | 03.11 | - | - |
| 9 | 10.11 | - | Домашнее Задание 4 - РНК-сек (Дмитрий Бушнев) |
| 10 | 17.11 | Некодирующие РНК | |
| 11 | 24.11 | - | Домашнее Задание 5 - single cell РНК-сек (Егор Фурсов) |
| 12 | 01.12 | - | |
| 13 | 08.12 | - | Домашнее Задание 6 |
| 14 | 15.12 | - | - |
| 15 | 22.12 | - | - |
| 16 | 29.12 | Экзамен | - |
