Майнор Биоинформатика 2 год 2021/22 — различия между версиями
Материал из Wiki - Факультет компьютерных наук
(→Модули 3 и 4 - Введение в эпигеномику) |
(→Модули 3 и 4 - Введение в эпигеномику) |
||
| Строка 13: | Строка 13: | ||
** Семинар '''Формат .bed и утилита bedtools''': [https://drive.google.com/file/d/166d5i3n3xcrK1AzczHynawLrGZ-HtjVH/view?usp=sharing слайды] | [https://colab.research.google.com/drive/1Xni3_z0mD7RSIdxUtOsiM6oWecDYZ6xH?usp=sharing Google Colab ноутбук] | ** Семинар '''Формат .bed и утилита bedtools''': [https://drive.google.com/file/d/166d5i3n3xcrK1AzczHynawLrGZ-HtjVH/view?usp=sharing слайды] | [https://colab.research.google.com/drive/1Xni3_z0mD7RSIdxUtOsiM6oWecDYZ6xH?usp=sharing Google Colab ноутбук] | ||
* Занятие 2: | * Занятие 2: | ||
| − | ** Лекция '''Метилирование ДНК''': [https://drive.google.com/file/d/1N6fjXW7hKuQASbgK_ERIuSr62d6ZlUNF/view?usp=sharing слайды] | + | ** Лекция '''Метилирование ДНК (введение)''': [https://drive.google.com/file/d/1N6fjXW7hKuQASbgK_ERIuSr62d6ZlUNF/view?usp=sharing слайды] |
| − | ** Семинар '''Метилирование ДНК | + | ** Семинар '''Метилирование ДНК (рассказ про ДЗ, Мурад Омаров)''' |
| + | * Занятие 3: | ||
| + | ** Лекция '''Методы определения метилирования ДНК''': [https://drive.google.com/file/d/1QJoKQT8lFjlaPIm8qmkpaVrK1TBKaL9t/view?usp=sharing слайды] | ||
| + | ** Семинар '''Анализ частоты CpG''': [https://colab.research.google.com/drive/1qlZ6LCmrzVPItzMGCEgVc8OqfB6p2742#scrollTo=G-2YPdmFQoLo Google colab] | ||
Версия 13:53, 10 февраля 2022
Модули 1 и 2 - Анализ данных секвенирования
Модули 3 и 4 - Введение в эпигеномику
- Домашнее задание 1 - Метилирование ДНК
- Занятие 1:
- Видео лекции и семинара
- Лекция Введение в эпигеномику: слайды
- Семинар Формат .bed и утилита bedtools: слайды | Google Colab ноутбук
- Занятие 2:
- Лекция Метилирование ДНК (введение): слайды
- Семинар Метилирование ДНК (рассказ про ДЗ, Мурад Омаров)
- Занятие 3:
- Лекция Методы определения метилирования ДНК: слайды
- Семинар Анализ частоты CpG: Google colab
