Майнор Биоинформатика 1 год — различия между версиями
Mpoptsova (обсуждение | вклад) (Новая страница: «'''Часть 1. Биоинформатика ДНК, РНК и белков (модули 1-2)''' <nowiki>В курсе «Элементарная гено…») |
Mpoptsova (обсуждение | вклад) |
||
| Строка 9: | Строка 9: | ||
| − | '''<big>Лекции</big>''' | + | '''<big>Лекции и семинары</big>''' |
'''Лекция 0.''' Организационная. Начало Лекции 1. | '''Лекция 0.''' Организационная. Начало Лекции 1. | ||
| Строка 16: | Строка 16: | ||
Клетка, геном, белки, поток информации, генетический код. <br /> | Клетка, геном, белки, поток информации, генетический код. <br /> | ||
[https://drive.google.com/open?id=1SEOTQyumGUff8Bwu54skDpu0ts38PfMG презентация] | [https://drive.google.com/open?id=1SEOTQyumGUff8Bwu54skDpu0ts38PfMG презентация] | ||
| + | |||
| + | '''Семинар 1''' Базы данных геномов бактерий. Файлы аннотации геномов генами. Стренды.<br /> | ||
| + | [https://drive.google.com/file/d/1dHBtuFLZ6A82C7PcY_8KJTLUu-RYXvv2/view?usp=sharing содержание] | ||
| + | |||
| + | |||
'''Лекция 2.''' Организация геномов прокариот и эукариот. Гены и регуляторные элементы. | '''Лекция 2.''' Организация геномов прокариот и эукариот. Гены и регуляторные элементы. | ||
Белок-кодирующие и РНК-кодирующие гены. Экзоны и интроны. Сплайсинг. Промоторы и энхансеры.<br /> | Белок-кодирующие и РНК-кодирующие гены. Экзоны и интроны. Сплайсинг. Промоторы и энхансеры.<br /> | ||
[https://drive.google.com/open?id=1ztbsYvKollDlx81Wd5ovTpsyn9_CB9DV презентация] | [https://drive.google.com/open?id=1ztbsYvKollDlx81Wd5ovTpsyn9_CB9DV презентация] | ||
| + | |||
| + | '''Семинар 2.''' Введение в систему Unix. Основные команды Unix. Файловая система. Навигация. Командная строка. Просмотр файлов. Bash-скрипты.<br /> | ||
| + | [https://drive.google.com/file/d/1SeCPSKKS6u8yQm33GBeHpa54z8kOp3-L/view?usp=sharing содержание] [https://drive.google.com/drive/folders/15GE3CiAMLPR8VfpkdOWdTJt_gDEeX0nx?usp=sharing данные] | ||
Версия 10:17, 16 сентября 2020
Часть 1. Биоинформатика ДНК, РНК и белков (модули 1-2)
В курсе «Элементарная геномика» изучаются основные закономерности молекулярной эволюции и математические методы анализа молекулярных последовательностей, включая алгоритмы поиска гомологичных последовательностей, выравнивания последовательностей и построения филогенетических деревьев, алгоритмы поиска ортологов и горизонтально перенесенных генов, предсказания генов и поиск мотивов, методы аннотации геномов de novo генами и функциональными элементами. Изучаются алгоритмы и методы предсказания вторичной структуры ДНК, РНК и белков.
В течение курса студенты познакомятся с основными биоинформатическими ресурсами, включая базы данных, веб-порталы, компьютерные программы для работы с базами данных молекулярной биологии, а также программами, реализующими биоинформатические методы.
Лекции и семинары
Лекция 0. Организационная. Начало Лекции 1.
Лекция 1. Введение. Основы молекулярной биологии.
Клетка, геном, белки, поток информации, генетический код.
презентация
Семинар 1 Базы данных геномов бактерий. Файлы аннотации геномов генами. Стренды.
содержание
Лекция 2. Организация геномов прокариот и эукариот. Гены и регуляторные элементы.
Белок-кодирующие и РНК-кодирующие гены. Экзоны и интроны. Сплайсинг. Промоторы и энхансеры.
презентация
Семинар 2. Введение в систему Unix. Основные команды Unix. Файловая система. Навигация. Командная строка. Просмотр файлов. Bash-скрипты.
содержание данные
