Определение генетической близости современных и древних людей (проект) — различия между версиями
(→Какие начальные требования?) |
(→Темы вводных занятий) |
||
| Строка 22: | Строка 22: | ||
=== Темы вводных занятий === | === Темы вводных занятий === | ||
| + | Основы статистики<br /> | ||
Генетика и антропогенез человека | Генетика и антропогенез человека | ||
Версия 00:33, 28 января 2015
| Ментор | Степанова Вита |
| Учебный семестр | Весна 2015 |
| Учебный курс | 1-й курс |
Что это за проект?
Методы молекулярной биологии активно используются для восстановления этногенеза различных народностей. В качестве проектной работы студентам предлагается разработать алгоритм определения степени родства современных этносов с древними людьми. Степень родства будет определяться с помощью сравнения одонуклеотидных полиморфизмов - точечных отличий последовательности внутри одного вида.
Чему вы научитесь?
Базовые знания генетики, знакомство со статистическими критериями и алгоритмами, использующимися в биологии
Какие начальные требования?
Навыки программирования, интерес к генетике и эволюции видов
Какие будут использоваться технологии?
В рамках проекта будут использоваться данные, доступные в базе данных 1000 геномов (www.1000genomes.org). Кроме того, возможно использование утилит для геномных подсчётов (bedtools и др.)
Темы вводных занятий
Основы статистики
Генетика и антропогенез человека
Направления развития
В рамках данного проекта возможна разработка веб-интерфейса программы подсчёта генетической близости внутри одного вида, использующей облачные техологии вычисления
Критерии оценки
4-5 определить генетическую близость данных современных и древних людей, используя готовые утилиты
6-7 определить генетическую близость данных современных и древних людей, использовав свой собственный алгоритм
8-10 определить генетическую близость данных современных и древних людей, использовав свой собственный алгоритм и статистику
