MinorBioinformatics — различия между версиями
Mpoptsova (обсуждение | вклад) |
|||
| Строка 13: | Строка 13: | ||
'''Лекция 1.''' Введение. Основы молекулярной биологии. | '''Лекция 1.''' Введение. Основы молекулярной биологии. | ||
Клетка, геном, белки, поток информации, генетический код. <br /> | Клетка, геном, белки, поток информации, генетический код. <br /> | ||
| − | + | [https://drive.google.com/open?id=1SEOTQyumGUff8Bwu54skDpu0ts38PfMG презентация] | |
| + | |||
| + | '''Лекция 2.''' Организация геномов прокариот и эукариот. Гены и регуляторные элементы. | ||
| + | Белок-кодирующие и РНК-кодирующие гены. Экзоны и интроны. Сплайсинг. Промоторы и энхансеры.<br /> | ||
| + | [https://drive.google.com/open?id=1ztbsYvKollDlx81Wd5ovTpsyn9_CB9DV презентация] | ||
| Строка 19: | Строка 23: | ||
'''Семинар 1.''' Введение в систему Unix. Основные команды Unix. Файловая система. Навигация. Командная строка. Просмотр файлов. Bash-скрипты.<br /> | '''Семинар 1.''' Введение в систему Unix. Основные команды Unix. Файловая система. Навигация. Командная строка. Просмотр файлов. Bash-скрипты.<br /> | ||
| − | + | [https://drive.google.com/open?id=1hLa__Y062bnLyZ4-vytNgD-Pn61Ff0SC содержание] [https://drive.google.com/drive/folders/1jszxyxC9TIo_RMlfp6FDfWw7gOIKP7Sb?usp=sharing данные] | |
| − | '''Семинар 2''' | + | '''Семинар 2''' Базы данных геномов бактерий, человека и разных видов. Файлы аннотации геномов генами. Стренды. Геномный браузер UCSC.<br /> |
| − | https:// | + | [https://drive.google.com/open?id=14zRZtVHzZEbtmBDOCZEiXSwufafvdsrR содержание] [https://drive.google.com/open?id=1ylKG_UwtBLNOEUJ49nvWePVhgfgaJsgN данные] |
Версия 18:08, 11 сентября 2019
Часть 1. Элементарная геномика (модули 1-2)
В курсе «Элементарная геномика» изучаются основные закономерности молекулярной эволюции и математические методы анализа молекулярных последовательностей, включая алгоритмы поиска гомологичных последовательностей, выравнивания последовательностей и построения филогенетических деревьев, алгоритмы поиска ортологов и горизонтально перенесенных генов, предсказания генов и поиск мотивов, методы аннотации геномов de novo генами и функциональными элементами. Изучаются алгоритмы и методы предсказания вторичной структуры ДНК, РНК и белков.
В течение курса студенты познакомятся с основными биоинформатическими ресурсами, включая базы данных, веб-порталы, компьютерные программы для работы с базами данных молекулярной биологии, а также программами, реализующими биоинформатические методы.
Лекции
Лекция 1. Введение. Основы молекулярной биологии.
Клетка, геном, белки, поток информации, генетический код.
презентация
Лекция 2. Организация геномов прокариот и эукариот. Гены и регуляторные элементы.
Белок-кодирующие и РНК-кодирующие гены. Экзоны и интроны. Сплайсинг. Промоторы и энхансеры.
презентация
Семинары
Семинар 1. Введение в систему Unix. Основные команды Unix. Файловая система. Навигация. Командная строка. Просмотр файлов. Bash-скрипты.
содержание данные
Семинар 2 Базы данных геномов бактерий, человека и разных видов. Файлы аннотации геномов генами. Стренды. Геномный браузер UCSC.
содержание данные
