Моделирование пространственной структуры РНК (front-end) (проект) — различия между версиями
(Новая страница: «{{Карточка_проекта |name=Моделирование пространственной структуры РНК (front-end) |mentor=Залевски…») |
|||
(не показана одна промежуточная версия ещё одного участника) | |||
Строка 7: | Строка 7: | ||
|summer= | |summer= | ||
|categorize=yes | |categorize=yes | ||
+ | |is_archived=yes | ||
}} | }} | ||
Строка 32: | Строка 33: | ||
=== Направления развития === | === Направления развития === | ||
− | + | * Реализовать очередь задач; | |
* Реализовать рассылку почтовых уведомлений о выполнении задачи; | * Реализовать рассылку почтовых уведомлений о выполнении задачи; | ||
* Реализовать ограниченный доступ к выдаче и файлам задачи; | * Реализовать ограниченный доступ к выдаче и файлам задачи; | ||
Строка 39: | Строка 40: | ||
=== Критерии оценки === | === Критерии оценки === | ||
− | 4-5 Переработать существующий протопип, реализовать базовую функциональность фронтэнда (загрузку данных, выдачу результата); <br/> | + | 4-5 Переработать существующий протопип, реализовать базовую функциональность фронтэнда (загрузку данных, очередь задач, рассылка уведомлений, выдачу результата); <br/> |
6-7 Реализовать ограничения доступа;<br/> | 6-7 Реализовать ограничения доступа;<br/> | ||
8-10 Реализовать интерактивную страницу с очередью и состоянием задачи. Реализовать визуализацию 3D структур РНК на странице с выдачей результатов. | 8-10 Реализовать интерактивную страницу с очередью и состоянием задачи. Реализовать визуализацию 3D структур РНК на странице с выдачей результатов. |
Текущая версия на 10:44, 20 октября 2015
Ментор | Залевский Артур |
Учебный семестр | Весна 2015 |
Учебный курс | 1-й курс |
Внимание! Данный проект находится в архиве и реализован не будет. |
Что это за проект?
Мы сформулировали и применили свой подход к реконструкции пространственной структуры РНК на основе данных о вторичной структуре и дополнительных дистанционных ограничений, который показал хорошие результаты при сравнении с полученными позже экспериментальными данными. После публикации статьи мы сделали веб-сервис, реализующий этот подход, однако он уже порядком устарел и мы хотели бы его существенно улучшить, как с точки зрения науки, так и качества реализации.
Чему вы научитесь?
- Познакомитесь с пространственными структурами различных биомолекул.
- Приобретете опыт по разработке веб-сервисов научной направленности.
Какие начальные требования?
- Желание разобраться в структурном многообразии нуклеиновых кислот.
- Желание создать научный веб-сервис
- Базовые знания ОС GNU/Linux.
- Базовые знания Shell, Python.
Какие будут использоваться технологии?
Темы вводных занятий
- Нуклеиновые кислоты, связь структура - функция.
Направления развития
- Реализовать очередь задач;
- Реализовать рассылку почтовых уведомлений о выполнении задачи;
- Реализовать ограниченный доступ к выдаче и файлам задачи;
- Реализовать интерактивную страницу с очередью и состоянием задачи;
- Реализовать визуализацию 3D структур биомолекул на странице с выдачей результатов.
Критерии оценки
4-5 Переработать существующий протопип, реализовать базовую функциональность фронтэнда (загрузку данных, очередь задач, рассылка уведомлений, выдачу результата);
6-7 Реализовать ограничения доступа;
8-10 Реализовать интерактивную страницу с очередью и состоянием задачи. Реализовать визуализацию 3D структур РНК на странице с выдачей результатов.