Майнор Биоинформатика 2 год 2023/24 — различия между версиями

Материал из Wiki - Факультет компьютерных наук
Перейти к: навигация, поиск
м (Лекции и семинары)
м (Лекции и семинары)
Строка 25: Строка 25:
 
||
 
||
 
Методы секвенирования ДНК [https://docs.google.com/presentation/d/1psM1yVHSo7Nw3o2XMuGvBD11oylynJFu/edit?usp=sharing&ouid=109540323021403462314&rtpof=true&sd=true слайды] [https://disk.yandex.ru/i/9IP3uZpyI6Ua5Q видео]
 
Методы секвенирования ДНК [https://docs.google.com/presentation/d/1psM1yVHSo7Nw3o2XMuGvBD11oylynJFu/edit?usp=sharing&ouid=109540323021403462314&rtpof=true&sd=true слайды] [https://disk.yandex.ru/i/9IP3uZpyI6Ua5Q видео]
|| Введение в github и Google colab
+
|| Введение в github и Google colab [https://colab.research.google.com/drive/1YlGpA_OLwR48mIO3MWuHbwFZk4D4fYwS?usp=sharing команды с занятия]
 
|-
 
|-
 
| 3
 
| 3

Версия 19:39, 23 сентября 2023

Модули 1 и 2 - Анализ данных секвенирования

Формула расчет оценки

Накоп = Округление( (ДЗ1+ДЗ2+ДЗ3+ДЗ4+ДЗ5+квиз)/6 )
Студент имеет право зачесть Накоп в качестве итоговой оценки, не приходя на экзамен.
В случае сдачи экзамена к оценке Накоп добавляется 0.3*Э. Экзамен письменный, оценивается по 10-бальной шкале

Лекции и семинары

Это примерный план, будут изменения.


# Дата Лекция (11:10 - 12:30) Семинар (12:40 - 14:00)
1 07.09

Введение в молекулярную биологию презентация видео

Создание аккаунтов на серверах инструкция

2 14.09

Методы секвенирования ДНК слайды видео

Введение в github и Google colab команды с занятия
3 21.09

Сборка генома слайды

ДЗ1 Сборка генома текст

4 28.09

Алгоритмы предсказания генов

Разбор домашнего задания 1

5 05.10

Аннотация функций генов

ДЗ2 Аннотация генома

6 12.10

Сдвиг рамки считывания

Семинар

7 19.10

Генная инженерия

ДЗ3 Предсказание генов

Сессия
8

Геном человека и некодирующие РНК

Повторы в геноме человека

9

Введение в РНК-сек

ДЗ4 РНК-сек

-
10

Анализ данных РНК-сек

Анализ данных РНК-сек

11

Проверочная работа по теме РНК-сек

ДЗ5 single cell РНК-сек

12

Секвенирование отдельных клеток

GWAS и популяционная генетика
13

Развитие жизни на Земле

Разбор оценок за все ДЗ
14 Экзамен