Майнор Биоинформатика 2 год 2023/24 — различия между версиями
Материал из Wiki - Факультет компьютерных наук
м (→Лекции и семинары) |
м (→Лекции и семинары) |
||
Строка 25: | Строка 25: | ||
|| | || | ||
Методы секвенирования ДНК [https://docs.google.com/presentation/d/1psM1yVHSo7Nw3o2XMuGvBD11oylynJFu/edit?usp=sharing&ouid=109540323021403462314&rtpof=true&sd=true слайды] [https://disk.yandex.ru/i/9IP3uZpyI6Ua5Q видео] | Методы секвенирования ДНК [https://docs.google.com/presentation/d/1psM1yVHSo7Nw3o2XMuGvBD11oylynJFu/edit?usp=sharing&ouid=109540323021403462314&rtpof=true&sd=true слайды] [https://disk.yandex.ru/i/9IP3uZpyI6Ua5Q видео] | ||
− | || Введение в github и Google colab | + | || Введение в github и Google colab [https://colab.research.google.com/drive/1YlGpA_OLwR48mIO3MWuHbwFZk4D4fYwS?usp=sharing команды с занятия] |
|- | |- | ||
| 3 | | 3 |
Версия 19:39, 23 сентября 2023
Модули 1 и 2 - Анализ данных секвенирования
Формула расчет оценки
Накоп = Округление( (ДЗ1+ДЗ2+ДЗ3+ДЗ4+ДЗ5+квиз)/6 ) Студент имеет право зачесть Накоп в качестве итоговой оценки, не приходя на экзамен. В случае сдачи экзамена к оценке Накоп добавляется 0.3*Э. Экзамен письменный, оценивается по 10-бальной шкале
Лекции и семинары
Это примерный план, будут изменения.
# | Дата | Лекция (11:10 - 12:30) | Семинар (12:40 - 14:00) |
---|---|---|---|
1 | 07.09 |
Введение в молекулярную биологию презентация видео |
Создание аккаунтов на серверах инструкция |
2 | 14.09 | Введение в github и Google colab команды с занятия | |
3 | 21.09 |
Сборка генома слайды |
ДЗ1 Сборка генома текст |
4 | 28.09 |
Алгоритмы предсказания генов |
Разбор домашнего задания 1 |
5 | 05.10 |
Аннотация функций генов |
ДЗ2 Аннотация генома |
6 | 12.10 |
Сдвиг рамки считывания |
Семинар |
7 | 19.10 |
Генная инженерия |
ДЗ3 Предсказание генов |
Сессия | |||
8 |
Геном человека и некодирующие РНК |
Повторы в геноме человека | |
9 |
Введение в РНК-сек |
ДЗ4 РНК-сек | |
- | |||
10 |
Анализ данных РНК-сек |
Анализ данных РНК-сек | |
11 |
Проверочная работа по теме РНК-сек |
ДЗ5 single cell РНК-сек | |
12 |
Секвенирование отдельных клеток |
GWAS и популяционная генетика | |
13 |
Развитие жизни на Земле |
Разбор оценок за все ДЗ | |
14 | Экзамен |