Майнор Биоинформатика 2 год 2025/26

Модули 3 и 4 - Введение в эпигеномику

Формула расчет оценки

Накоп = Округление(0.3*ДЗ  +  0.3*ПРОЕКТ + 0.1*КВИЗЫ + 0.3 Экзамен), где
ПРОЕКТ = 0.7*Инд_часть + 0.3*Групповая_часть
ДЗ - средняя за ДЗ
КВИЗЫ - средняя за КВИЗЫ 
Если все квизы и ДЗ написаны удовлетворительно,то студент может получить автомат по формуле:
Накоп = Округление((0.3*ДЗ  +  0.3*ПРОЕКТ + 0.1*КВИЗЫ)/7*10)
Экзамен письменный, оценивается по 10-бальной шкале

Лекции и семинары

#	Дата	Лекция (11:10 - 12:30)	Семинар (12:40 - 14:00)
1	22.01	Метагеномика часть 1 лекция	Введение в R. тетрадка
2	29.01	Метагеномика часть 2. Abundance analysis лекция	Практика в R. тетрадка
2	05.02	Метагеномика часть 3. Diversity, correlation, annotation лекция	Практика в R. тетрадка

Модули 1 и 2 - Анализ данных секвенирования

Формула расчет оценки

Накоп = Округление( Среднее(ДЗ1+ДЗ2+ДЗ3+ДЗ4+ДЗ5+квиз)*0.7 )
Студент имеет право зачесть Накоп в качестве итоговой оценки, не приходя на экзамен.
В случае сдачи экзамена к оценке Накоп добавляется 0.3*Э. Экзамен письменный, оценивается по 10-бальной шкале

Лекции и семинары

#	Дата	Лекция (11:10 - 12:30)	Семинар (12:40 - 14:00)
1	04.09	Введение в молекулярную биологию лекция	Создание аккаунтов на серверах инструкция
2	11.09	Методы секвенирования ДНК лекция	Введение в github и Google colab. Sra toolkit тетрадка
3	18.09	Сборка генома слайды	FastQC, MultiQC, cборка генома
4	26.09	Алгоритмы предсказания генов слайды	Алгоритмы предсказания генов. Практика
5	03.10	Аннотация функций генов. Домены. слайды	InterPro. PFam. HMMER.
6	9.10	Сдвиг рамки считывания	Семинар
7	16.10	Некодирующие РНК слайды	Infernal, tRNAscan
8	23.10	Введение в РНК-сек слайды	Введение в R, Deseq2
9	06.11	Анализ данных РНК-сек слайды	ДЗ3 РНК-сек. scRNA-seq QC тетрадка
10	13.11	Анализ данных РНК-сек часть 2 слайды	Семинар тетрадка
9	27.11	Определение типа клеток. слайды	Семинар тетрадка
9	06.11	Остальные виды анализа данных РНК-сек слайды	ДЗ34 scРНК-сек